21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1159 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  692    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0823  hypothetical protein  28.85 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0781  hypothetical protein  28.65 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2047  hypothetical protein  27.89 
 
 		 354 aa  102  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.697732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2054  hypothetical protein  27.45 
 
 		 384 aa  102  8e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  30.15 
 
 		 528 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  29.22 
 
 		 535 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  26.38 
 
 		 540 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  29.34 
 
 		 503 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  35.62 
 
 		 2402 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  29.52 
 
 		 565 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  29.03 
 
 		 532 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  26.01 
 
 		 523 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  31.82 
 
 		 3794 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1064 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  24.68 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  32.43 
 
 		 890 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  32.84 
 
 		 561 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1313 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  31.88 
 
 		 2262 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  25.87 
 
 		 938 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>