16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2054 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  801    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.818637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0823  hypothetical protein  26.88 
 
 		 352 aa  126  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.920784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0781  hypothetical protein  25.13 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1159  hypothetical protein  27.45 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2047  hypothetical protein  26.51 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.697732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  28.22 
 
 		 540 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  32.35 
 
 		 523 aa  52.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1064 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  29.07 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  25.14 
 
 		 532 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  27.37 
 
 		 528 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.37 
 
 		 575 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  26.28 
 
 		 565 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29.79 
 
 		 2402 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  24.18 
 
 		 575 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  46.15 
 
 		 750 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>