146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2552 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  100 
 
 		 750 aa  1526    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  48.1 
 
 		 2367 aa  389  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  47.93 
 
 		 2421 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  48.1 
 
 		 2411 aa  389  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  47.68 
 
 		 2454 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  47.31 
 
 		 2807 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  37.97 
 
 		 2772 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1059 aa  216  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  42.28 
 
 		 953 aa  190  8e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  47.78 
 
 		 1259 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  34.16 
 
 		 1371 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  26.34 
 
 		 627 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  34.32 
 
 		 1389 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  35.23 
 
 		 1162 aa  101  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.59 
 
 		 815 aa  101  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  28.68 
 
 		 886 aa  97.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  33.03 
 
 		 2064 aa  95.9  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  35.09 
 
 		 3227 aa  94.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  37.01 
 
 		 637 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  35.46 
 
 		 799 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  31.5 
 
 		 496 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  42.05 
 
 		 1483 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  46.51 
 
 		 2005 aa  86.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.75 
 
 		 2927 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  34.07 
 
 		 822 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  27.18 
 
 		 1526 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.9 
 
 		 2296 aa  84.3  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  32.57 
 
 		 794 aa  80.9  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1547 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1064 aa  79  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  36.52 
 
 		 792 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  39.56 
 
 		 1066 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1287 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  38.95 
 
 		 3737 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  28.87 
 
 		 642 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  29.69 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.08 
 
 		 636 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  27.16 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  38.64 
 
 		 3602 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  38.38 
 
 		 3793 aa  74.3  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  26.88 
 
 		 657 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  34.35 
 
 		 561 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  30.29 
 
 		 1079 aa  72  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  32.2 
 
 		 599 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  42.53 
 
 		 1139 aa  70.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  36.56 
 
 		 4896 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.16 
 
 		 1620 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  26.09 
 
 		 808 aa  69.3  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  39.13 
 
 		 2267 aa  68.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35.79 
 
 		 711 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.11 
 
 		 1602 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  38.27 
 
 		 3324 aa  67.4  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  35.62 
 
 		 885 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1461 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  28.26 
 
 		 871 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  35.35 
 
 		 3191 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  38.95 
 
 		 2478 aa  65.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  37.14 
 
 		 5745 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  30.82 
 
 		 890 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.53 
 
 		 2377 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  25.66 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.5 
 
 		 4071 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  29.7 
 
 		 1140 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  39.73 
 
 		 852 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  28.57 
 
 		 1345 aa  63.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  32.68 
 
 		 2588 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  41.89 
 
 		 315 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  36.13 
 
 		 2602 aa  62.4  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.11 
 
 		 2713 aa  62.4  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  31.78 
 
 		 774 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1313 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  36.46 
 
 		 3471 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  32.67 
 
 		 2022 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  24.34 
 
 		 581 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29.73 
 
 		 2402 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  37.35 
 
 		 2487 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1665 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  42.31 
 
 		 3958 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  28.14 
 
 		 6497 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  30 
 
 		 963 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  26.92 
 
 		 1097 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  30 
 
 		 969 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  30.08 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  37.23 
 
 		 676 aa  58.5  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  26.76 
 
 		 1657 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  25.82 
 
 		 1527 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  35.87 
 
 		 2364 aa  57.4  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.91 
 
 		 2270 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  35.63 
 
 		 429 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  35.87 
 
 		 860 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  28.31 
 
 		 1466 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1488 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  40 
 
 		 1193 aa  55.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1329 aa  54.3  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  27.4 
 
 		 2833 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1976 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  29.15 
 
 		 797 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 5298 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  29.85 
 
 		 950 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  30.77 
 
 		 540 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>