66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1188 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  100 
 
 		 1389 aa  2692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  53.85 
 
 		 1679 aa  845    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  39.73 
 
 		 401 aa  181  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  33.11 
 
 		 618 aa  170  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  30.64 
 
 		 631 aa  164  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  29.18 
 
 		 816 aa  154  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  34.24 
 
 		 484 aa  143  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  34.81 
 
 		 424 aa  128  6e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  36.96 
 
 		 318 aa  125  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  38.24 
 
 		 452 aa  122  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  34.69 
 
 		 386 aa  119  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  35.27 
 
 		 277 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  44.81 
 
 		 428 aa  112  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  30.41 
 
 		 479 aa  109  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  33.98 
 
 		 586 aa  109  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  35.09 
 
 		 450 aa  108  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  36.06 
 
 		 1059 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  30.26 
 
 		 581 aa  100  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  28.82 
 
 		 416 aa  95.9  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 439 aa  84  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  29.59 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  37.99 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  30.42 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  37.16 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  28.43 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  36.94 
 
 		 763 aa  68.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.15 
 
 		 1266 aa  65.1  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  32.74 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  28.5 
 
 		 419 aa  64.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  29.89 
 
 		 539 aa  62.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  31.95 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  35.47 
 
 		 863 aa  62  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  36.6 
 
 		 1041 aa  62  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  27.55 
 
 		 355 aa  56.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  33.68 
 
 		 535 aa  55.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  33.96 
 
 		 191 aa  53.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  33.52 
 
 		 528 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.14 
 
 		 877 aa  53.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  38.64 
 
 		 669 aa  53.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  33.69 
 
 		 772 aa  53.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1052 aa  52.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  31.27 
 
 		 523 aa  52  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29268  Hypothetical ORF Leucine rich repeat protein  34.75 
 
 		 647 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106866  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  28.57 
 
 		 431 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  30.23 
 
 		 443 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  30.23 
 
 		 443 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01441  hypothetical protein  30.23 
 
 		 318 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  29.46 
 
 		 419 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01429  hypothetical protein  30.23 
 
 		 318 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_73960  predicted protein  47.54 
 
 		 1335 aa  50.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.847897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  30.23 
 
 		 418 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  32.22 
 
 		 788 aa  49.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  32.22 
 
 		 788 aa  48.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03245  hypothetical protein  28.74 
 
 		 406 aa  48.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  29.01 
 
 		 755 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  31.8 
 
 		 788 aa  47.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0577  hypothetical protein  32.43 
 
 		 229 aa  47.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  29.75 
 
 		 1118 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  27.59 
 
 		 765 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  18.58 
 
 		 1163 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.9 
 
 		 1749 aa  45.8  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.35 
 
 		 476 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2924  hypothetical protein  33.33 
 
 		 620 aa  45.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  25.89 
 
 		 1344 aa  45.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  27.35 
 
 		 193 aa  45.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  35.19 
 
 		 1780 aa  45.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>