35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04855 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  30.6 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  31.61 
 
 		 581 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  32.41 
 
 		 586 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  32.48 
 
 		 631 aa  58.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  31.09 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01441  hypothetical protein  33.64 
 
 		 318 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  33.64 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  33.64 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  33.64 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01429  hypothetical protein  33.64 
 
 		 318 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  39.82 
 
 		 863 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  32.35 
 
 		 418 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1389 aa  53.9  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  32.71 
 
 		 419 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  27.84 
 
 		 479 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  28.87 
 
 		 816 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  29.49 
 
 		 277 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  30.6 
 
 		 273 aa  50.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  30.61 
 
 		 355 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.58 
 
 		 1679 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1059 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  35.14 
 
 		 419 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  27.86 
 
 		 424 aa  45.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  29.34 
 
 		 484 aa  45.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  34.68 
 
 		 565 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  30.3 
 
 		 1266 aa  43.9  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1744 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  28.68 
 
 		 1052 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  36.64 
 
 		 1015 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  27.19 
 
 		 401 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  26.83 
 
 		 1070 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  33.93 
 
 		 528 aa  43.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  26.83 
 
 		 1070 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  25 
 
 		 1112 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>