33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1374 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  100 
 
 		 428 aa  877    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  35.91 
 
 		 618 aa  176  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  28.93 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  40.67 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  29.18 
 
 		 401 aa  122  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.85 
 
 		 1679 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  44.81 
 
 		 1389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  32.48 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  32.53 
 
 		 318 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  36.26 
 
 		 581 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  32.16 
 
 		 586 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  34.78 
 
 		 479 aa  99.8  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  35.03 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  38.62 
 
 		 273 aa  96.7  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  35.58 
 
 		 277 aa  96.3  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  34.76 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  35.2 
 
 		 631 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 439 aa  87  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  32.61 
 
 		 816 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1059 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0577  hypothetical protein  31.01 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  24.2 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  27.21 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1969  hypothetical protein  36.62 
 
 		 300 aa  55.1  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.643947 
 
 
-
 
NC_002950  PG0495  hypothetical protein  34.21 
 
 		 469 aa  53.5  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45196 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  28.7 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  26.86 
 
 		 384 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  33.52 
 
 		 788 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  33.52 
 
 		 788 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  33.52 
 
 		 788 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  34.29 
 
 		 843 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  27.96 
 
 		 350 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 		 1332 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>