44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13363 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  100 
 
 		 416 aa  818    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  34.95 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.68 
 
 		 1679 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  28.66 
 
 		 1389 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  31.33 
 
 		 618 aa  87  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  28.79 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  30.6 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  29.02 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  28.57 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  32.75 
 
 		 450 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  27.56 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1059 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  29.07 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  28.19 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  24.2 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  27.44 
 
 		 816 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1070 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  31.71 
 
 		 243 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  30.88 
 
 		 1441 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  32.2 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  28.03 
 
 		 439 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  31.61 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  37.7 
 
 		 919 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  33.75 
 
 		 700 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  37.04 
 
 		 1118 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  34.48 
 
 		 469 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  37.33 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.65 
 
 		 665 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  30.68 
 
 		 595 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  30.68 
 
 		 588 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  33.82 
 
 		 558 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  29.27 
 
 		 528 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  29.82 
 
 		 631 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  29.41 
 
 		 801 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4317  hypothetical protein  27.17 
 
 		 620 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0690853 
 
 
-
 
NC_002950  PG1798  immunoreactive 46 kDa antigen PG99  35 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  33.78 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1031 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04856  hypothetical protein  39.22 
 
 		 164 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09933  hypothetical protein  29.92 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  27.34 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  31.76 
 
 		 861 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  27.94 
 
 		 726 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 541 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>