38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03265 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1071    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  31.17 
 
 		 1441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  38.71 
 
 		 874 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  37.65 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1024 aa  57  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  37.35 
 
 		 654 aa  54.3  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07560  thermolysin precursor  32 
 
 		 1250 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  31.71 
 
 		 416 aa  52  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  33.72 
 
 		 935 aa  51.2  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  30.34 
 
 		 887 aa  50.4  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1031 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1070 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  31.18 
 
 		 937 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04410  hypothetical protein  30.95 
 
 		 501 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  28.07 
 
 		 861 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  25.58 
 
 		 927 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  30.53 
 
 		 669 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  35.94 
 
 		 843 aa  48.1  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  32.18 
 
 		 365 aa  47.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  47.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  28.69 
 
 		 2239 aa  47  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  33.33 
 
 		 739 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01330  hypothetical protein  30.56 
 
 		 306 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.719075  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  33.78 
 
 		 192 aa  46.2  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1969  hypothetical protein  26.39 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.643947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  33.75 
 
 		 946 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0427  mannosidase-related protein  27.76 
 
 		 2443 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.37928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  32.1 
 
 		 726 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  30.23 
 
 		 1251 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09193  hypothetical protein  31.58 
 
 		 560 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.210532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  27.84 
 
 		 957 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  31.18 
 
 		 243 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  30.59 
 
 		 639 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  23.7 
 
 		 984 aa  44.3  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  27.36 
 
 		 540 aa  43.5  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 859 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  26.97 
 
 		 787 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>