43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09933 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09933  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  675    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  22.19 
 
 		 652 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1667 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  32.95 
 
 		 1441 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  21.72 
 
 		 882 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  25.73 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.03 
 
 		 1170 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  23.08 
 
 		 504 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.87 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  27.41 
 
 		 1094 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.75 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  26.14 
 
 		 556 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4436  hypothetical protein  20.22 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0659418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  23.86 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  26 
 
 		 479 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.81 
 
 		 517 aa  47.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1257  hypothetical protein  20.26 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  28.4 
 
 		 542 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.14 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  22.69 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  22.57 
 
 		 581 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.7 
 
 		 2296 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  32.22 
 
 		 2239 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  32.32 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  19.19 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  29.92 
 
 		 416 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  20.82 
 
 		 510 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  28.9 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.02 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  25.44 
 
 		 819 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  23.24 
 
 		 810 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.71 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  24.86 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.64 
 
 		 533 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.377717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.12 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  37.14 
 
 		 924 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  43.5  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  30.48 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  30.48 
 
 		 324 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  20.4 
 
 		 502 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.95 
 
 		 521 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  33.33 
 
 		 425 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  31.43 
 
 		 461 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>