67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1231 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 919 aa  1852    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  50.38 
 
 		 1409 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  38.94 
 
 		 317 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  35.91 
 
 		 769 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  34.08 
 
 		 1316 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  34.74 
 
 		 365 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  28.65 
 
 		 462 aa  111  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  32.84 
 
 		 527 aa  108  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  37.08 
 
 		 512 aa  107  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  32.62 
 
 		 594 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  32.37 
 
 		 335 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  33.01 
 
 		 327 aa  102  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  38.16 
 
 		 482 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  31.14 
 
 		 922 aa  99  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  35.16 
 
 		 327 aa  97.8  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  34.62 
 
 		 365 aa  97.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  34.39 
 
 		 501 aa  94.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  29.14 
 
 		 375 aa  90.9  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  30.3 
 
 		 351 aa  89.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  27.79 
 
 		 376 aa  89.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  30.08 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  27.7 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  28.85 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  31.87 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  27.25 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  31.56 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  27.53 
 
 		 374 aa  79.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  32.34 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  28.01 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  27.25 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  33.68 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  28.97 
 
 		 686 aa  78.2  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  27.8 
 
 		 374 aa  73.9  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  30.05 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  28.08 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  27.82 
 
 		 375 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  28.66 
 
 		 405 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  29.27 
 
 		 402 aa  70.9  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  28.81 
 
 		 397 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  32.81 
 
 		 522 aa  66.2  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  30.25 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  29.44 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  29.33 
 
 		 449 aa  63.9  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  29.05 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  27.9 
 
 		 794 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  25.33 
 
 		 991 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  29.73 
 
 		 436 aa  60.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  26.64 
 
 		 730 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  28.32 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  29.36 
 
 		 346 aa  57.4  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  35.16 
 
 		 504 aa  57  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  39.29 
 
 		 505 aa  55.8  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35 
 
 		 474 aa  55.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  53.5  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2150  hypothetical protein  44.83 
 
 		 356 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  25.48 
 
 		 498 aa  52.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  27.12 
 
 		 392 aa  51.2  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  32.26 
 
 		 483 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  37.7 
 
 		 416 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.67 
 
 		 1679 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  36.11 
 
 		 192 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  40.54 
 
 		 501 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  37.33 
 
 		 672 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  27.81 
 
 		 377 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  43.1 
 
 		 1437 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  33.75 
 
 		 461 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  45.76 
 
 		 365 aa  45.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>