86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10308 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  100 
 
 		 365 aa  759    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  47.55 
 
 		 538 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  46.62 
 
 		 539 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  40.06 
 
 		 617 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  44.18 
 
 		 614 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  40.86 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  29.16 
 
 		 657 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  33.98 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  33.21 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  33.11 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  34.23 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  32.82 
 
 		 539 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  32.82 
 
 		 542 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  35.55 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  35.16 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  34.77 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  34.77 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  31.54 
 
 		 558 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  34.51 
 
 		 275 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  31.15 
 
 		 558 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  31.06 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  29.39 
 
 		 1346 aa  99.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  27.63 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  39.41 
 
 		 1503 aa  97.1  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  32.97 
 
 		 267 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  30.58 
 
 		 596 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  34.48 
 
 		 1310 aa  88.6  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  29.07 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  34.81 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  27.41 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  33.54 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  31.68 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  41.56 
 
 		 654 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  37.89 
 
 		 1093 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  29.75 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  26.59 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  32.1 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  32.1 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  32.1 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  26.75 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  31.65 
 
 		 232 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 874 aa  52.8  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  30.22 
 
 		 232 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  25.71 
 
 		 219 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  31.65 
 
 		 233 aa  50.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.15 
 
 		 2160 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  29.79 
 
 		 540 aa  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  30.77 
 
 		 232 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05425  hypothetical protein  39.22 
 
 		 316 aa  47.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.246659  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  30.39 
 
 		 669 aa  46.6  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3267  endonuclease I  27.01 
 
 		 235 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0010351  normal  0.0484419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3256  endonuclease I  27.01 
 
 		 235 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000148246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3332  endonuclease I  26.39 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.387366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  33.77 
 
 		 772 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04145  metalloprotease, putative  34.88 
 
 		 935 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.18498  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  32.56 
 
 		 887 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  26.53 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  26.24 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  27.86 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000648022  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3436  endonuclease I  26.39 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00127424  hitchhiker  0.00168464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2389  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.11 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.377717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3340  endonuclease I  26.39 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00611255  normal  0.202483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  27.54 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  45.76 
 
 		 919 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  27.54 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  27.54 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  27.54 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  27.54 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  27.54 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  28.99 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4024  deoxyribonuclease I  27.66 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000163525  decreased coverage  0.000370071 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1073  hypothetical protein  30 
 
 		 568 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09933  hypothetical protein  32.32 
 
 		 349 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  37.5 
 
 		 2042 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  26.81 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0411  hemagglutinin, putative  23.03 
 
 		 925 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  35.62 
 
 		 469 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  32.18 
 
 		 528 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  27.27 
 
 		 1061 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  27.01 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
NC_002950  PG2100  immunoreactive 63 kDa antigen PG102  25.84 
 
 		 554 aa  43.9  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.586482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  27.01 
 
 		 235 aa  43.5  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0547  hypothetical protein  28.21 
 
 		 112 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  26.62 
 
 		 235 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1458  Deoxyribonuclease I  24.32 
 
 		 249 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.118773  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  32.88 
 
 		 1441 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>