292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4964 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  100 
 
 		 794 aa  1614    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  83.33 
 
 		 487 aa  720    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  87.63 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  49.66 
 
 		 686 aa  283  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  44.86 
 
 		 567 aa  234  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  42.77 
 
 		 627 aa  226  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1246  Pectinesterase  42.95 
 
 		 560 aa  220  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  43.61 
 
 		 730 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1391  Pectinesterase  43.88 
 
 		 347 aa  212  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00169458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4663  Pectinesterase  43.97 
 
 		 334 aa  209  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0682309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1157  Pectinesterase  37.66 
 
 		 322 aa  180  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3049  Pectinesterase  37.62 
 
 		 326 aa  173  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  38.63 
 
 		 571 aa  173  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0447  pectinesterase  37.73 
 
 		 376 aa  171  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1149  Pectinesterase  35.67 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  36.72 
 
 		 391 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1812  Pectinesterase  37.31 
 
 		 326 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  32.84 
 
 		 644 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4096  pectinesterase  33.65 
 
 		 338 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.557872  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0138  putative pectinesterase  36.31 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.356938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0501  pectinesterase  36.18 
 
 		 447 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00373  putative pectinesterase  36.51 
 
 		 393 aa  147  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.350288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4787  Pectinesterase  31.38 
 
 		 337 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.669677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  35.67 
 
 		 335 aa  144  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  37.13 
 
 		 327 aa  144  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4248  pectate lyase  32.08 
 
 		 666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.38518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  32.59 
 
 		 365 aa  141  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  32.48 
 
 		 317 aa  137  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  35.13 
 
 		 482 aa  137  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0433  Pectinesterase  34.18 
 
 		 457 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.825978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1301  pectinesterase  29.41 
 
 		 345 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1087  Pectinesterase  32.65 
 
 		 366 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.925496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3047  Pectinesterase  33.73 
 
 		 368 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1228  Pectinesterase  33.53 
 
 		 368 aa  125  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2766  Pectinesterase  32.14 
 
 		 366 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422306  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  32.87 
 
 		 527 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4146  putative pectinesterase  31.37 
 
 		 400 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4427  putative pectinesterase  32.13 
 
 		 400 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.681186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  30.23 
 
 		 865 aa  118  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2469  putative pectinesterase  30.96 
 
 		 434 aa  114  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  27.56 
 
 		 351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3511  pectinesterase A  29.87 
 
 		 361 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0844  pectinesterase A  29.87 
 
 		 361 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3639  pectinesterase  29.87 
 
 		 361 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1259  putative pectinesterase  31.69 
 
 		 427 aa  107  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0881  putative pectinesterase  30.28 
 
 		 427 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  29.97 
 
 		 594 aa  105  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0850  putative pectinesterase  29.93 
 
 		 427 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0795  putative pectinesterase  29.88 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.253968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0913  putative pectinesterase  29.93 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0822  putative pectinesterase  28.9 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0936  putative pectinesterase  29.93 
 
 		 427 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0876  putative pectinesterase  29.13 
 
 		 427 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  28.67 
 
 		 922 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00725  predicted pectinesterase  29.88 
 
 		 427 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00760581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2870  Pectinesterase  29.88 
 
 		 427 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00700  hypothetical protein  29.88 
 
 		 427 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0826  putative pectinesterase  29.88 
 
 		 427 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0907325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0799  putative pectinesterase  29.88 
 
 		 427 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2469  Pectinesterase  29.17 
 
 		 746 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.151342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2890  putative pectinesterase  29.88 
 
 		 427 aa  102  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0446001  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2580  putative pectinesterase  29.88 
 
 		 427 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.390355  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  32.2 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  28.18 
 
 		 462 aa  100  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  29.25 
 
 		 365 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  28.28 
 
 		 501 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  29.31 
 
 		 512 aa  96.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  38.24 
 
 		 427 aa  93.2  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  35.71 
 
 		 806 aa  91.3  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  28.14 
 
 		 375 aa  91.3  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  42.66 
 
 		 436 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  32.07 
 
 		 385 aa  89  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03390  Pectinesterase (EC 3.1.1.11) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B7U0]  31.76 
 
 		 325 aa  88.6  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.798545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  38.67 
 
 		 494 aa  88.2  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  31.73 
 
 		 449 aa  87.8  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  37.04 
 
 		 806 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.78 
 
 		 476 aa  87.4  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  37.04 
 
 		 806 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  37.04 
 
 		 806 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.04 
 
 		 806 aa  87.4  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  26.74 
 
 		 769 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0944  ribosomal protein L30  31.93 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000748406 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  36.42 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  36.42 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.42 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  39.22 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  26.74 
 
 		 1316 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  28.02 
 
 		 405 aa  83.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  28.42 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  37.78 
 
 		 566 aa  82.4  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  32.02 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.61 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  30.69 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  33 
 
 		 427 aa  80.5  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  34.31 
 
 		 1207 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  39.39 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  34.48 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  27.49 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  30.62 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.51 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>