66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2168 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  79.04 
 
 		 501 aa  752    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  100 
 
 		 512 aa  1036    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  57.55 
 
 		 1316 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  58.48 
 
 		 769 aa  547  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  74.32 
 
 		 365 aa  522  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  37.29 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  37.13 
 
 		 527 aa  196  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  33.09 
 
 		 922 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  34.27 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  29.69 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  32.65 
 
 		 335 aa  130  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  29 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  32.74 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  33.46 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  31.48 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  28.74 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  31.73 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  32.52 
 
 		 385 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  31.56 
 
 		 374 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  30.9 
 
 		 317 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  35.68 
 
 		 1409 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  29.8 
 
 		 375 aa  110  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  28.23 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  28.57 
 
 		 686 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  29.89 
 
 		 374 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  37.08 
 
 		 919 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  27.87 
 
 		 374 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  27.86 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  32 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  28.95 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  29.72 
 
 		 405 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  32.43 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  30.4 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  31.34 
 
 		 380 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  29.31 
 
 		 794 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  30.21 
 
 		 482 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  30.66 
 
 		 402 aa  91.3  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29.31 
 
 		 474 aa  91.3  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  29.31 
 
 		 392 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  25.93 
 
 		 498 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  30.6 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  26.37 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  26.88 
 
 		 991 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  30.09 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  26.35 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  28.9 
 
 		 747 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  28.34 
 
 		 522 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  28.69 
 
 		 346 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  26.79 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  29.91 
 
 		 427 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  29.07 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  27.85 
 
 		 554 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  27.54 
 
 		 730 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  27.71 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  27.24 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  29.07 
 
 		 314 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  28.52 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  26.48 
 
 		 504 aa  57  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  23.08 
 
 		 505 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  30.46 
 
 		 143 aa  52.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  26.55 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  26.95 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  79.17 
 
 		 1056 aa  47.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  26.19 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  26.7 
 
 		 377 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  22.57 
 
 		 543 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>