76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1848 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 317 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  74.56 
 
 		 482 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  56.92 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  38.01 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  35.48 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  35.78 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  41.05 
 
 		 554 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  33.51 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  37.77 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  36.07 
 
 		 991 aa  160  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  34.83 
 
 		 375 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  35.69 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  32.55 
 
 		 405 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  33.02 
 
 		 686 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  34.82 
 
 		 527 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.35 
 
 		 486 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  35.81 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  31.25 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  39.01 
 
 		 435 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.48 
 
 		 794 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  38.77 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  32.95 
 
 		 474 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  39.46 
 
 		 436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  33.06 
 
 		 462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  35.81 
 
 		 1409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  39.41 
 
 		 427 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  37.44 
 
 		 449 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  38.94 
 
 		 919 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  40.5 
 
 		 730 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  33.08 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  29.6 
 
 		 594 aa  119  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  39 
 
 		 427 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  30.79 
 
 		 512 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  30.34 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  32.12 
 
 		 922 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  34.5 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  31.79 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  32.75 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  33.8 
 
 		 522 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  31.88 
 
 		 501 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  28.53 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  29.43 
 
 		 769 aa  102  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  30.41 
 
 		 374 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  31.15 
 
 		 374 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  28.83 
 
 		 1316 aa  99.4  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  30.16 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  30.77 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  31.15 
 
 		 374 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  29.62 
 
 		 376 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  29.91 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  29.3 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  31.75 
 
 		 505 aa  92.4  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  32.62 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  30.89 
 
 		 314 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  30.73 
 
 		 504 aa  89.7  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  28.85 
 
 		 375 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  31.51 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  32.66 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  32.66 
 
 		 421 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  28.74 
 
 		 543 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  30.81 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02331  Pectin lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU6]  26.05 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.37768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  28.06 
 
 		 555 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  32.82 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  33.7 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10147  conserved hypothetical protein  22.33 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.705837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  24.14 
 
 		 398 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  27.72 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  27.81 
 
 		 747 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  30.52 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  30.91 
 
 		 682 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  32.79 
 
 		 770 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  34.13 
 
 		 772 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  27.94 
 
 		 454 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05333  pectate lyase (Eurofung)  28.22 
 
 		 421 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>