67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2764 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 402 aa  808    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  69.77 
 
 		 405 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  71.99 
 
 		 385 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  66.49 
 
 		 397 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  58.4 
 
 		 392 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  39.45 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  43.94 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  36.97 
 
 		 498 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  34.32 
 
 		 449 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  32.35 
 
 		 456 aa  189  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  34.9 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  30.91 
 
 		 505 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  33.92 
 
 		 427 aa  179  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  36.91 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  36.59 
 
 		 427 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  38.05 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  31.07 
 
 		 504 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  32.9 
 
 		 730 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  34 
 
 		 317 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  32.99 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  38.24 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  34.78 
 
 		 327 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  32.07 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  34.63 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  33 
 
 		 991 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  35.78 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  35.77 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  31.45 
 
 		 368 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  33.62 
 
 		 335 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  25.55 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  26.19 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  32.95 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  32.95 
 
 		 922 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  27.17 
 
 		 594 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  28.74 
 
 		 1316 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  29.74 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  27.62 
 
 		 512 aa  77  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  39.08 
 
 		 272 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  30.96 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  27.76 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  26.71 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  27.23 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  29.86 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  27.47 
 
 		 769 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  34.73 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  27.99 
 
 		 1409 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  29.27 
 
 		 919 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  35.15 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  26.85 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  37.17 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  35.86 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  33.1 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  37.39 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.67 
 
 		 794 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  34.73 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  25.73 
 
 		 686 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.11 
 
 		 474 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  33.63 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  27.27 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  26.84 
 
 		 501 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02331  Pectin lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU6]  28.11 
 
 		 392 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.37768  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  27.64 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  24.16 
 
 		 377 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  23.38 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  25.93 
 
 		 143 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4283  pectin lyase  27.78 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  35.63 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>