58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3881 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  61.17 
 
 		 1316 aa  752    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  100 
 
 		 747 aa  1501    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  39.84 
 
 		 511 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2947  hypothetical protein  54.31 
 
 		 574 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00368039  normal  0.813372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1650  pseudouridine synthase, Rsu  44.39 
 
 		 914 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  38.57 
 
 		 700 aa  89  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  37.12 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  37.96 
 
 		 769 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  36.36 
 
 		 772 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1008  Pectate disaccharide-lyase  32.59 
 
 		 540 aa  76.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  30.4 
 
 		 594 aa  74.3  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  29.52 
 
 		 365 aa  73.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  36.94 
 
 		 554 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  28.9 
 
 		 512 aa  73.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.04 
 
 		 831 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  28.9 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  31.11 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0246  carbohydrate-binding family 6 protein  33.94 
 
 		 820 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  27.52 
 
 		 374 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  32.73 
 
 		 649 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  34.51 
 
 		 365 aa  69.7  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  29.36 
 
 		 375 aa  67.4  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.86 
 
 		 809 aa  65.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  28.97 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2655  Carbohydrate binding family 6  37.04 
 
 		 847 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  27.69 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  28.26 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  28.1 
 
 		 374 aa  62  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  27.98 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8075  Carbohydrate binding family 6  33.06 
 
 		 401 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  28.84 
 
 		 527 aa  58.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  28.49 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  25.19 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  35.19 
 
 		 2073 aa  55.8  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  31.25 
 
 		 397 aa  54.3  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  28.35 
 
 		 392 aa  54.3  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  28.06 
 
 		 435 aa  54.3  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  31.39 
 
 		 482 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  24.37 
 
 		 1409 aa  53.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  34.13 
 
 		 628 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  25.65 
 
 		 449 aa  52.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  26.92 
 
 		 335 aa  52.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  28.57 
 
 		 436 aa  51.2  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  24.39 
 
 		 991 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  26.55 
 
 		 486 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  28.4 
 
 		 317 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  30.94 
 
 		 327 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  27.23 
 
 		 427 aa  48.9  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  25.95 
 
 		 922 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3331  carbohydrate-binding family 6 protein  29.73 
 
 		 747 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  26.78 
 
 		 462 aa  48.5  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  27.32 
 
 		 385 aa  48.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  26.29 
 
 		 427 aa  47.8  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  31.25 
 
 		 1016 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  26.56 
 
 		 327 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  29.79 
 
 		 730 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2137  cellulosome enzyme, dockerin type I  31.03 
 
 		 790 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  25.64 
 
 		 368 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>