69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2763 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 397 aa  815    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  69.45 
 
 		 392 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  66.49 
 
 		 402 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  63.3 
 
 		 405 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  65.8 
 
 		 385 aa  504  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  36.91 
 
 		 380 aa  269  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  42.36 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  35.89 
 
 		 449 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  35.31 
 
 		 498 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  33.98 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  34.46 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  32.76 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  30.3 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  36.1 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  36.13 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  32.63 
 
 		 504 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  31.55 
 
 		 730 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  30.15 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  34.19 
 
 		 317 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  37.33 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  34.77 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  33 
 
 		 554 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  37.43 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  33.57 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  34.66 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  34.69 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  31.23 
 
 		 991 aa  106  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  29.72 
 
 		 486 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  31.91 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  25.95 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  28.38 
 
 		 1316 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  31.56 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  30.4 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  28.06 
 
 		 769 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  29.55 
 
 		 462 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  27.54 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  32.76 
 
 		 922 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  27.49 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  27.04 
 
 		 594 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  29.76 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  25.68 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  29.05 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  38.46 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  30.14 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  25.28 
 
 		 1409 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  27.56 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  26.59 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  28.72 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  32.5 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  25.53 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  26.33 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  27.92 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  28.4 
 
 		 919 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  27.92 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  25.83 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  27.45 
 
 		 794 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  24.46 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  26.96 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  28.16 
 
 		 555 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  23.42 
 
 		 686 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  28.16 
 
 		 543 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  31.25 
 
 		 747 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  31.41 
 
 		 143 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  25.73 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02331  Pectin lyase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU6]  27.75 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.37768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  26.42 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  27.52 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09439  pectin lyase (Eurofung)  25.57 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  35.9 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>