236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6915 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  100 
 
 		 482 aa  963    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  75.62 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  59.32 
 
 		 327 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  34.53 
 
 		 474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  56.38 
 
 		 427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  39.81 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  41.5 
 
 		 351 aa  189  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  39.62 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  37.94 
 
 		 991 aa  170  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  37.22 
 
 		 327 aa  156  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  37.67 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  54.55 
 
 		 576 aa  156  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  31.63 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  32.9 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 375 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.88 
 
 		 486 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  40 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  57.46 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  34.85 
 
 		 368 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  39.72 
 
 		 435 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  35.09 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  35.13 
 
 		 794 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  35.83 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  34.26 
 
 		 686 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  40.81 
 
 		 436 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  31.91 
 
 		 594 aa  137  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  31.75 
 
 		 380 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  32.95 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  34.34 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  40.39 
 
 		 427 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  37.44 
 
 		 1409 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  33.74 
 
 		 922 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  38.28 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  41.48 
 
 		 919 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  38.12 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  44.32 
 
 		 730 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  30.95 
 
 		 346 aa  114  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  37.56 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  30.55 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  33.96 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  29.72 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  29.87 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  30.15 
 
 		 769 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  31.18 
 
 		 374 aa  103  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  35.36 
 
 		 522 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  30.18 
 
 		 1316 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  29.22 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  29.68 
 
 		 501 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  30.92 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  28.66 
 
 		 375 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  31.48 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  30.29 
 
 		 374 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  29.64 
 
 		 374 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  30.15 
 
 		 375 aa  94  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  40.58 
 
 		 771 aa  93.6  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  33.33 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  29.23 
 
 		 314 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  39.13 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  28.66 
 
 		 375 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  28.31 
 
 		 314 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  35.76 
 
 		 806 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  35.76 
 
 		 806 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  35.76 
 
 		 806 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  35.76 
 
 		 806 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  35.76 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  35.76 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  35.76 
 
 		 806 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.54 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  33.13 
 
 		 806 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  46.07 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.57 
 
 		 1567 aa  77.8  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  26.09 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  38.26 
 
 		 1100 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  33.8 
 
 		 672 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  29.95 
 
 		 1000 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  33.33 
 
 		 1222 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  29.39 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  33.58 
 
 		 618 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  36.69 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  37.01 
 
 		 1259 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  41.38 
 
 		 1016 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.9 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  36.22 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  35.46 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  30.34 
 
 		 571 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  39.23 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.72 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  30.26 
 
 		 858 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.26 
 
 		 858 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.26 
 
 		 858 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  32.61 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  30.26 
 
 		 805 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  30.26 
 
 		 807 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  30.26 
 
 		 800 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  30.26 
 
 		 800 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  33.77 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.78 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.46 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  26.29 
 
 		 543 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>