88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1286 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  41.11 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  39.29 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  44.16 
 
 		 119 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  35.05 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  41.57 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  29.29 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  32.65 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  35 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  28.43 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  36.78 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  34.04 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  38.16 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  39.74 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  39.51 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 112 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  36.25 
 
 		 113 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 112 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  32.89 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  36.96 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  34.41 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  32.05 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 		 623 aa  55.1  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  41.1 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 358 aa  52.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  44.19 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  33.71 
 
 		 97 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 		 117 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  38.03 
 
 		 72 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 749 aa  51.6  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  32.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  34.18 
 
 		 116 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  26.73 
 
 		 111 aa  50.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  26.32 
 
 		 336 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  35.8 
 
 		 104 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  32.26 
 
 		 112 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  33.33 
 
 		 264 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  31.51 
 
 		 157 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 		 105 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  32.22 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 		 123 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  32.97 
 
 		 125 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  35.62 
 
 		 280 aa  47.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 		 104 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  32.67 
 
 		 815 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  30.34 
 
 		 97 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  36.11 
 
 		 919 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  26.44 
 
 		 539 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  32.89 
 
 		 116 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  32.89 
 
 		 116 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  32.89 
 
 		 116 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.07 
 
 		 665 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  31.94 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  32.89 
 
 		 124 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  41.67 
 
 		 150 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.89 
 
 		 124 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 		 137 aa  44.7  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.89 
 
 		 100 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.89 
 
 		 99 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  28.24 
 
 		 119 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  39.08 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  37.33 
 
 		 456 aa  43.5  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  34.25 
 
 		 957 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  34.15 
 
 		 127 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  25.93 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  27.03 
 
 		 726 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  35.21 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1798  immunoreactive 46 kDa antigen PG99  26.09 
 
 		 405 aa  42.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 		 130 aa  42.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  29.41 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.11 
 
 		 140 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  29.41 
 
 		 119 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  42.4  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  32.47 
 
 		 1668 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  35.21 
 
 		 146 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  30.16 
 
 		 2239 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  28.21 
 
 		 123 aa  42  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  31.71 
 
 		 167 aa  42  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4880  putative amicyanin protein  32.71 
 
 		 106 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.266193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  27.78 
 
 		 444 aa  41.2  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  29.06 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1024 aa  41.2  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  36.62 
 
 		 147 aa  41.2  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>