93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2129 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
137 aa  280  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  55.15 
 
 
144 aa  159  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  56.74 
 
 
141 aa  153  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  45.14 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  46.53 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  45.26 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  47.01 
 
 
807 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  40.67 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  30.11 
 
 
235 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  34.75 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  38.38 
 
 
221 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  35.25 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  33.96 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  33.96 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  29.29 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  29.5 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  34.69 
 
 
173 aa  57  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  28.57 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  34.74 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  30.61 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  29.05 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  32.08 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  37.76 
 
 
358 aa  53.9  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  32.08 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  32.74 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  32.32 
 
 
545 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  38.78 
 
 
347 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  31.13 
 
 
116 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  30.19 
 
 
116 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  27.81 
 
 
336 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  39.22 
 
 
318 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  36 
 
 
186 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  30.99 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  34.34 
 
 
179 aa  50.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  30.48 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  30.19 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  30.19 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  31.43 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  33.67 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  32.32 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  37.76 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  37 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  32.74 
 
 
218 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  27.54 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  34.02 
 
 
172 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  25.89 
 
 
111 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  27.2 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  29.85 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  32.38 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  31 
 
 
623 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  30.28 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  34.95 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  31.58 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  33.98 
 
 
315 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  30.61 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  30.48 
 
 
264 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  30 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  33.64 
 
 
212 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  27.5 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  31.3 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  26.98 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  29.37 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  26.05 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  35.35 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  32.32 
 
 
136 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  29.91 
 
 
119 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.95 
 
 
749 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  27.61 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 
539 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  32.73 
 
 
209 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  30 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.66 
 
 
417 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  25.47 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  27.59 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  33.01 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  26.88 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  28.21 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  28.07 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  28.57 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  26.92 
 
 
301 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  28.57 
 
 
168 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  32.67 
 
 
231 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  30.61 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0493  blue (type1) copper domain-containing protein  26.23 
 
 
318 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  26.95 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  30.19 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  30 
 
 
444 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  29.79 
 
 
112 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  29.57 
 
 
224 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  44.44 
 
 
210 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>