71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0263 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
146 aa  300  5.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  35.61 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  37.96 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  32.39 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  37.19 
 
 
173 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  36.89 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  34.29 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  43.04 
 
 
187 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  40.26 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  33.67 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  33.96 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  35.05 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  36.47 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  37.65 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  37.65 
 
 
146 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  31.78 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  32.97 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  31.63 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  37.66 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  34.26 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  34.94 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  35.37 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  34.94 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  35.56 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  29.82 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  36.27 
 
 
221 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  35.06 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  33.7 
 
 
235 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  27.96 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  32.76 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  32.29 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  32.29 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  32.29 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  35.9 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.25 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  27.97 
 
 
150 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  36.25 
 
 
347 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  36.36 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  34.78 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  36.36 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  36.36 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  32.41 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  35.44 
 
 
292 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  36.56 
 
 
486 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  43.28 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  34.52 
 
 
209 aa  47  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  31.25 
 
 
116 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  32.61 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  33.33 
 
 
192 aa  46.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  32.99 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  34.62 
 
 
210 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  34.62 
 
 
224 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  32.5 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  31.25 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  35.29 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  33.94 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  31.82 
 
 
209 aa  43.9  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  29.57 
 
 
116 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  26.05 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  29.13 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  29.57 
 
 
116 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  28.97 
 
 
807 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  29.06 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  30.59 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
214 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  34.62 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  31.53 
 
 
139 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  29.41 
 
 
133 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  25.4 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.03 
 
 
749 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>