More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1408 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 
957 aa  1970    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05045  putative alpha-amylase  42.49 
 
 
937 aa  735    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.408257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  36.84 
 
 
958 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  35.57 
 
 
990 aa  514  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1279  alpha amylase catalytic region  24.73 
 
 
560 aa  164  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4273  alpha amylase catalytic region  26.73 
 
 
543 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3692  alpha amylase catalytic region  30.53 
 
 
551 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0536  alpha amylase catalytic region  24.17 
 
 
552 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4479  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 
552 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1302  alpha amylase catalytic region  32.08 
 
 
541 aa  115  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.312205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5461  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.02 
 
 
587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01554  1,4-alpha-glucan branching enzyme  29.49 
 
 
623 aa  111  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2113  alpha amylase, catalytic region  28.95 
 
 
590 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0213  glycoside hydrolase family 13 domain protein  35.57 
 
 
607 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000901025  normal  0.0389775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2358  isoamylase family protein  35.47 
 
 
630 aa  108  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3467  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.97 
 
 
612 aa  106  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2574  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.52 
 
 
610 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0923119  normal  0.935867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3269  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.91 
 
 
621 aa  105  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0535  alpha amylase catalytic region  25.85 
 
 
554 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1790  alpha-amylase  30.92 
 
 
624 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.890851 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2805  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.52 
 
 
561 aa  103  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244463  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.24 
 
 
586 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413399  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.24 
 
 
596 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334686  hitchhiker  0.00587548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1226  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  36.47 
 
 
606 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2793  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.85 
 
 
586 aa  100  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584085  decreased coverage  0.00000363421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1173  alpha amylase domain-containing protein  24.88 
 
 
592 aa  100  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5116  putative 1,4-alpha-glucan branching enzyme  26.44 
 
 
653 aa  100  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1403  alpha amylase, catalytic region  26.22 
 
 
625 aa  99.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2011  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.02 
 
 
638 aa  99  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.935259  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1809  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.61 
 
 
618 aa  99.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1428  glycoside hydrolase family protein  31.77 
 
 
606 aa  99  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6209  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.61 
 
 
621 aa  99  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1490  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.15 
 
 
610 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.227729  normal  0.484955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3126  alpha-amylase family protein  35.56 
 
 
604 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.524605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0241  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.55 
 
 
581 aa  97.8  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1827  alpha amylase catalytic region  28.34 
 
 
754 aa  97.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2421  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 
593 aa  97.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0413  glycoside hydrolase family 13 domain protein  27.27 
 
 
637 aa  96.3  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1428  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.25 
 
 
605 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0818981  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.89 
 
 
598 aa  97.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551631  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1205  alpha amylase  32.09 
 
 
594 aa  95.9  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1983  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.41 
 
 
611 aa  95.9  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236935  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  24.6 
 
 
577 aa  95.9  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.816613  normal  0.363157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4389  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.33 
 
 
636 aa  95.5  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.452822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2993  Alpha amylase, catalytic region  34.44 
 
 
604 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0819444  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1462  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.21 
 
 
587 aa  95.5  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4560  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.35 
 
 
600 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0506  glycoside hydrolase  31.75 
 
 
606 aa  95.1  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1207  alpha amylase catalytic region  32.02 
 
 
745 aa  94.7  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4621  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.81 
 
 
608 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00732341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5281  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.65 
 
 
642 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.64117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1394  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.74 
 
 
605 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4048  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.55 
 
 
613 aa  93.2  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3935  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.55 
 
 
613 aa  93.2  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0534162  normal  0.77528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2548  Alpha amylase, catalytic region  35.36 
 
 
600 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1739  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.61 
 
 
618 aa  93.6  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158802  hitchhiker  0.000847686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1674  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.11 
 
 
594 aa  93.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2082  alpha-amylase family protein  30.61 
 
 
618 aa  93.6  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2675  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.32 
 
 
607 aa  92.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845749  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1783  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.56 
 
 
594 aa  92  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0318  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.12 
 
 
604 aa  92.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.464158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1672  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.56 
 
 
594 aa  92  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1737  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.56 
 
 
594 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2267  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.87 
 
 
609 aa  92  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2027  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 
876 aa  91.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748072  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1605  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.56 
 
 
594 aa  91.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4408  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.32 
 
 
601 aa  91.3  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.354382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2349  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.29 
 
 
614 aa  91.3  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.249555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2157  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.22 
 
 
587 aa  90.5  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332832  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1781  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.41 
 
 
592 aa  90.9  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2092  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  33.33 
 
 
592 aa  90.1  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03374  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.78 
 
 
553 aa  89.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2865  putative trehalose trehalohydrolase  32.98 
 
 
640 aa  90.1  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.944811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.23 
 
 
640 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3486  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.44 
 
 
587 aa  89  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0132  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.18 
 
 
629 aa  89  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0544  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.53 
 
 
572 aa  88.6  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6343  normal  0.630983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0113  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.72 
 
 
629 aa  88.6  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0767542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5112  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.34 
 
 
630 aa  88.6  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1880  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.44 
 
 
587 aa  88.6  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24900  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.41 
 
 
601 aa  88.2  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.355935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6325  putative maltooligosyltrehalose trehalohydrolase  30.56 
 
 
589 aa  87.8  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2984  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.51 
 
 
607 aa  87.8  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340631  decreased coverage  0.00906327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1347  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  30.81 
 
 
593 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0540  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.98 
 
 
603 aa  87.4  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0397  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  26.53 
 
 
613 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.714045  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1541  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.22 
 
 
634 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2278  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  25.86 
 
 
584 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380817  hitchhiker  0.00913073 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0818  maltooligosyl trehalose trehalohydrolase, putative  32.22 
 
 
580 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1735  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.02 
 
 
634 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1564  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  32.02 
 
 
634 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0166062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2295  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  27.03 
 
 
672 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.219229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5166  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  28.9 
 
 
594 aa  86.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.155383  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0617  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  32.22 
 
 
580 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.357584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6825  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  31.38 
 
 
640 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309899  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2937  malto-oligosyltrehalose trehalohydrolase  29.51 
 
 
601 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919612  hitchhiker  0.00396871 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1336  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  32.22 
 
 
580 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.844442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0538  putative maltooligosyl trehalose trehalohydrolase  32.22 
 
 
580 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  23.53 
 
 
595 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4715  alpha amylase catalytic region  34.34 
 
 
818 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>