38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0650 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  35.71 
 
 
214 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  38.41 
 
 
216 aa  105  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  32.58 
 
 
223 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  31.11 
 
 
230 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  32.14 
 
 
218 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  31.12 
 
 
225 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  31.12 
 
 
225 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  31.12 
 
 
225 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  30.61 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  33.75 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  38.81 
 
 
223 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  36.94 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  39.01 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  36.05 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  37.4 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  35.29 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  34.48 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  32.39 
 
 
215 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  33.76 
 
 
216 aa  89  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  38.97 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  32.24 
 
 
237 aa  85.1  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  36.88 
 
 
239 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  31.88 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  29.52 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  34.09 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  34.09 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  31.58 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  32.14 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  32.95 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  26.92 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  32.91 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  29.35 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  32.14 
 
 
109 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  28.3 
 
 
107 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.8 
 
 
417 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1903  hypothetical protein  27.82 
 
 
254 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.511504  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  31.18 
 
 
179 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>