140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1088 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  100 
 
 		 125 aa  259  8.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  69.49 
 
 		 119 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  69.49 
 
 		 119 aa  184  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  63.72 
 
 		 116 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  55.2 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  59.02 
 
 		 119 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  63.72 
 
 		 116 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  62.28 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  56.56 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  62.83 
 
 		 116 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  61.4 
 
 		 116 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  54.92 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  58.06 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  60.18 
 
 		 116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  45.74 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  45.65 
 
 		 139 aa  116  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  45.99 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  49.52 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  37.6 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  33.09 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  38.32 
 
 		 347 aa  67  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  34 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  40 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  36.44 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  35.87 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  36 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  46.05 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  33.04 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  36 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  34.38 
 
 		 292 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  38.6 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  33.33 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  39.8 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  32.37 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  38.96 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  38.89 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  30.36 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  38.89 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.5 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  33.94 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  35.71 
 
 		 131 aa  57  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  33.94 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  38.04 
 
 		 205 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.91 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  40.62 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  33.33 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  34.78 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  30.61 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  34.74 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  31.36 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  33.33 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  30.17 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  31.73 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  36.05 
 
 		 358 aa  51.2  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  30.7 
 
 		 160 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  34.45 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  37.36 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  34.12 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  30.7 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  29.9 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  35.71 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  31.82 
 
 		 264 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  27.27 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  37.31 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  29.9 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  32.91 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  32.56 
 
 		 235 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  30.7 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  32.95 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  35.82 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  31.68 
 
 		 545 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  35.06 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  40.62 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  32.97 
 
 		 192 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  39.29 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  29.82 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  29.66 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  43.04 
 
 		 766 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  25.23 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  30.6 
 
 		 336 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  35.87 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  30.09 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  24.37 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  32.05 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  28.8 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  31 
 
 		 807 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  29.59 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  26.92 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  35.8 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  34.85 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30.1 
 
 		 486 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  30.28 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  35.48 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>