219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2298 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 301 aa  589  1e-167  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  40.4 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.88 
 
 		 163 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  43.17 
 
 		 163 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  41.26 
 
 		 161 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  36.11 
 
 		 201 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  40.85 
 
 		 215 aa  90.9  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  34.21 
 
 		 167 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.76 
 
 		 133 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 133 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 		 133 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  38.57 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  36.76 
 
 		 151 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.61 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  36.5 
 
 		 596 aa  82.8  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.81 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  34.42 
 
 		 164 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  39.69 
 
 		 166 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  32.73 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.86 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  34.38 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  33.56 
 
 		 611 aa  79  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  34.53 
 
 		 165 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.97 
 
 		 139 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  35.22 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  31.43 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  36.23 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.21 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  35.21 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  34.33 
 
 		 778 aa  75.9  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  33.1 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  32.37 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  35.25 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  33.09 
 
 		 187 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.73 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  33.91 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  32.32 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  33.13 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  36.3 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  35.51 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  30.46 
 
 		 157 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  34.23 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  34.23 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  40.6 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  32.62 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  34.9 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  34.84 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  40.6 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  37.8 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  33.77 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  31.01 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  36.42 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  32.39 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  35.04 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  37.84 
 
 		 168 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  34.78 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  35.04 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 		 194 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  30.56 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  31.39 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.75 
 
 		 558 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  32.61 
 
 		 143 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  35.76 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  37.17 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  67  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  32.61 
 
 		 183 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  33.6 
 
 		 143 aa  67  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  34.87 
 
 		 150 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  32.85 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  29.55 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  35.25 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  30.99 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  42.11 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  32.59 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  28.46 
 
 		 142 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  46.27 
 
 		 623 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  41.07 
 
 		 157 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  29.69 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  38.64 
 
 		 114 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  45.71 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  33.77 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  32.39 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  35.94 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  31.79 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  47.76 
 
 		 97 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0596  beta-Ig-H3/fasciclin  32.39 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0278  beta-Ig-H3/fasciclin  32.61 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216669  normal  0.0952762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  34.51 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  50.77 
 
 		 97 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  35.77 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  31.85 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  33.12 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>