169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1399 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  48.92 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  47.48 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  45.71 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  42.33 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  45.71 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  42.33 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  40 
 
 		 189 aa  134  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  45.89 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  42.2 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  45.21 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  43.84 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  45.89 
 
 		 202 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  40.22 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  45.21 
 
 		 183 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.43 
 
 		 220 aa  124  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  46.1 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  42.86 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  43.84 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  43.15 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  44.6 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  43.92 
 
 		 184 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  36.41 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  35.87 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  42.47 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  42.47 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  41.1 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  42.25 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  39.02 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.11 
 
 		 558 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  41.43 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  41.43 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  42.07 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  41.78 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  42.38 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  41.01 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  41.55 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  41.01 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  40.54 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.03 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  40.41 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  39.73 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  37.68 
 
 		 166 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  40.71 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  36.43 
 
 		 163 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  37.18 
 
 		 279 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  36.69 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  45.83 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  41.55 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  43.22 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  39.72 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  39.55 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.68 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  40.44 
 
 		 164 aa  99.4  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  39.57 
 
 		 160 aa  99.4  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  36.31 
 
 		 201 aa  99  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  42.98 
 
 		 160 aa  98.2  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  33.53 
 
 		 238 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  38.73 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  40.29 
 
 		 161 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  35.54 
 
 		 354 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.23 
 
 		 308 aa  95.5  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  41.82 
 
 		 190 aa  95.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 167 aa  95.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.43 
 
 		 141 aa  94.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  32.34 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  44.25 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  38.4 
 
 		 150 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 163 aa  85.9  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  30.94 
 
 		 141 aa  85.9  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.57 
 
 		 133 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  39.68 
 
 		 133 aa  85.5  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  41.74 
 
 		 157 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  33.09 
 
 		 135 aa  85.1  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  38.36 
 
 		 169 aa  84.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  36.43 
 
 		 151 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  32.12 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  35.25 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.06 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  32.88 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  32.65 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  40.5 
 
 		 596 aa  81.3  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  32.85 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  32.85 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  40.22 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  39.71 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  39.71 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  35.76 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.71 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  32.12 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  28.67 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  35.57 
 
 		 611 aa  74.7  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  34.35 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0596  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>