171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1375 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  100 
 
 		 611 aa  1181    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  39.17 
 
 		 346 aa  147  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.86 
 
 		 308 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.97 
 
 		 186 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  54.48 
 
 		 141 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  51.85 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  50.38 
 
 		 134 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  50.37 
 
 		 187 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  30.12 
 
 		 596 aa  112  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  50.37 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 		 165 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  47.41 
 
 		 166 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  44.83 
 
 		 202 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  31.54 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.01 
 
 		 139 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  44.97 
 
 		 190 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  44.97 
 
 		 190 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  47.1 
 
 		 160 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  50.75 
 
 		 168 aa  102  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  47.83 
 
 		 162 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  48.48 
 
 		 133 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  31.01 
 
 		 318 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  43.7 
 
 		 164 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  38.22 
 
 		 193 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  47.18 
 
 		 163 aa  99.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  45.65 
 
 		 156 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  49.26 
 
 		 208 aa  98.2  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  42.96 
 
 		 238 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  43.57 
 
 		 195 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  42.76 
 
 		 183 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  45.26 
 
 		 156 aa  97.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.12 
 
 		 133 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  35.28 
 
 		 337 aa  97.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  40.74 
 
 		 167 aa  95.9  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  40.71 
 
 		 184 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  42.07 
 
 		 189 aa  95.1  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  42.57 
 
 		 184 aa  94  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.51 
 
 		 558 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  40.58 
 
 		 279 aa  93.2  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  41.43 
 
 		 169 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  42.07 
 
 		 185 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  45.65 
 
 		 178 aa  92.8  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  42.76 
 
 		 187 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  42.28 
 
 		 186 aa  92  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 151 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  41.38 
 
 		 184 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  40.71 
 
 		 193 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  40.71 
 
 		 194 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  41.13 
 
 		 191 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  43.94 
 
 		 133 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 		 220 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  42 
 
 		 191 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  41.38 
 
 		 183 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.75 
 
 		 261 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  42.67 
 
 		 184 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 		 233 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  42.28 
 
 		 186 aa  89  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  35.08 
 
 		 201 aa  88.2  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  42.07 
 
 		 194 aa  87.8  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  42.07 
 
 		 194 aa  87.8  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  35.59 
 
 		 160 aa  87.4  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  41.26 
 
 		 160 aa  87.4  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  40.29 
 
 		 160 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  37.23 
 
 		 194 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  42.14 
 
 		 133 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  39.31 
 
 		 194 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  42.14 
 
 		 133 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  34.56 
 
 		 142 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  45 
 
 		 157 aa  85.5  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  35.25 
 
 		 135 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  47.57 
 
 		 214 aa  85.1  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  40.69 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  42.73 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  38.81 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  39.73 
 
 		 183 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  39.26 
 
 		 216 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  36.5 
 
 		 134 aa  83.6  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  37.09 
 
 		 193 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  35.77 
 
 		 134 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  40.58 
 
 		 194 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  45.05 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  41.33 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  44.23 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  44.23 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  44.23 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  40.43 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0404  hypothetical protein  36.84 
 
 		 194 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000383864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  40.6 
 
 		 235 aa  80.1  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  35.14 
 
 		 185 aa  80.1  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  38.06 
 
 		 222 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  36.36 
 
 		 200 aa  79.7  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  38.16 
 
 		 184 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  34.53 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 		 140 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>