138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0278 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0278  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 151 aa  297  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216669  normal  0.0952762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 		 261 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.35 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  34.03 
 
 		 238 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.15 
 
 		 141 aa  84  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  38.64 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  39.34 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  33.85 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 596 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  33.82 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  34.56 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  36.67 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  38.64 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  38.71 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  35.96 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  32.87 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  32.82 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  32.84 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 		 186 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  31.62 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0021  beta-Ig-H3/fasciclin  33.83 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  36.5 
 
 		 215 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  31.88 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  31.88 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  30.6 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  34.31 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  32.45 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.31 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  33.55 
 
 		 346 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  31.16 
 
 		 161 aa  67  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  30.66 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  33.82 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.37 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  30.26 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  29.8 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  30.26 
 
 		 191 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  30.3 
 
 		 194 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  31.33 
 
 		 190 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  31.33 
 
 		 190 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  32.37 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  34.62 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  33.06 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  33.06 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  31.97 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  33.33 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  27.54 
 
 		 611 aa  60.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  29.61 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  27.54 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  29.66 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  31.78 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  27.27 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  29.92 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  29.93 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  29.75 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  29.14 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  29.8 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  26.67 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1726  beta-Ig-H3/fasciclin  29.29 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  27.78 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.22 
 
 		 308 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  33.58 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  30.6 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  29.71 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  27.74 
 
 		 330 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  31.65 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  26.97 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.83 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  37.4 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  28.48 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  30.77 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  25.56 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  31.97 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  31.4 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.62 
 
 		 558 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5227  beta-Ig-H3/fasciclin  31.62 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.273546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  28.1 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  33.02 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  30.92 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  26 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  29.14 
 
 		 183 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  33.04 
 
 		 220 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  27.21 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  33.02 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  27.1 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  32.26 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  28.8 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  26.8 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  26.8 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  31.62 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  29.3 
 
 		 185 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  28.93 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  27.13 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>