170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0485 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
194 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  84.54 
 
 
195 aa  327  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  91.24 
 
 
193 aa  320  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  83.51 
 
 
191 aa  290  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  79.9 
 
 
184 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  72.67 
 
 
184 aa  228  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  72.5 
 
 
183 aa  227  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  63.18 
 
 
186 aa  222  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  70 
 
 
194 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  70 
 
 
194 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  70.06 
 
 
187 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  59.6 
 
 
183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  62.37 
 
 
193 aa  210  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  68.35 
 
 
186 aa  209  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  70.51 
 
 
202 aa  207  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  64.81 
 
 
184 aa  205  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  67.3 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  67.3 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  67.08 
 
 
191 aa  198  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  63.98 
 
 
189 aa  191  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  66.46 
 
 
184 aa  191  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  59.26 
 
 
185 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  63.69 
 
 
184 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  63.23 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  63.46 
 
 
189 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  52.76 
 
 
184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  62.89 
 
 
184 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  61.64 
 
 
185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  60.65 
 
 
185 aa  178  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  60 
 
 
187 aa  174  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  57.05 
 
 
183 aa  168  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  45.6 
 
 
166 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  46.11 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  54.35 
 
 
156 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  53.57 
 
 
160 aa  141  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  53.62 
 
 
156 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  54.05 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  45.71 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  56.83 
 
 
134 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  53.02 
 
 
162 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  52.52 
 
 
165 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  41.75 
 
 
202 aa  134  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  56.12 
 
 
141 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  50.36 
 
 
161 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  52.17 
 
 
187 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  49.3 
 
 
210 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  52.17 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  51.45 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  53.62 
 
 
208 aa  128  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  47.52 
 
 
163 aa  127  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  47.14 
 
 
164 aa  125  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  49.64 
 
 
167 aa  125  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 
194 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  48.91 
 
 
133 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.27 
 
 
186 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  41.57 
 
 
238 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  47.57 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  47.14 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  51.05 
 
 
190 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  46.1 
 
 
279 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  43.02 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.83 
 
 
133 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  48.55 
 
 
133 aa  115  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.66 
 
 
558 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.97 
 
 
261 aa  114  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  45.26 
 
 
133 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  45.26 
 
 
133 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  47.18 
 
 
169 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 
160 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  51.88 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  46.38 
 
 
142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.15 
 
 
308 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.89 
 
 
220 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  51.45 
 
 
168 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  45.65 
 
 
151 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  45.52 
 
 
150 aa  106  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  46.83 
 
 
160 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  40.79 
 
 
596 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  46.46 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  48.57 
 
 
157 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  42.14 
 
 
194 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  40.24 
 
 
161 aa  98.6  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 
354 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  36.6 
 
 
184 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.29 
 
 
139 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.97 
 
 
133 aa  90.5  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  34.17 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  47.62 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  32.17 
 
 
135 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  33.81 
 
 
139 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  37.68 
 
 
134 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  33.67 
 
 
200 aa  88.2  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  40.71 
 
 
611 aa  87.8  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
163 aa  88.2  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
163 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  39.37 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  44.09 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  41.78 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  39.86 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>