159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2094 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
133 aa  265  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  62.41 
 
 
151 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  62.41 
 
 
133 aa  166  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  61.65 
 
 
133 aa  164  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  62.41 
 
 
133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  62.41 
 
 
133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  58.65 
 
 
133 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.27 
 
 
141 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  42.42 
 
 
134 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  47.69 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  46.15 
 
 
187 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  45.38 
 
 
187 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  45.11 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  43.18 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  44.7 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  44.27 
 
 
162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 
139 aa  107  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  43.51 
 
 
165 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  41.98 
 
 
187 aa  105  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 
156 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  40.46 
 
 
166 aa  104  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  41.22 
 
 
161 aa  103  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  48.06 
 
 
168 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
279 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.07 
 
 
220 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  45.52 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  43.18 
 
 
166 aa  97.1  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  36.92 
 
 
208 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  45.04 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.17 
 
 
186 aa  93.6  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  40.44 
 
 
193 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  39.71 
 
 
195 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.51 
 
 
194 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 
190 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 
190 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  39.71 
 
 
191 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  39.16 
 
 
186 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 
183 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  29.55 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  38.57 
 
 
184 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  41.1 
 
 
191 aa  90.1  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  38.97 
 
 
194 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  38.62 
 
 
184 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  38.36 
 
 
193 aa  88.2  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  39.69 
 
 
185 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  38.33 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  36.64 
 
 
238 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  38.06 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  41.35 
 
 
190 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.57 
 
 
558 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  36.11 
 
 
189 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 
194 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 
194 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  36.67 
 
 
167 aa  83.6  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  41.18 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  30.47 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  41.1 
 
 
183 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  40.28 
 
 
186 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  37.06 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  38.66 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  36.64 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  37.82 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  32.58 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  35.62 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  41.32 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  37.12 
 
 
611 aa  78.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  37.61 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  36.81 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  37.24 
 
 
185 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  35.11 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  34.75 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  35.38 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.1 
 
 
308 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.11 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  36.7 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  36.11 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  36.13 
 
 
596 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  31.71 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  28.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  37.93 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  32.89 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  37.93 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  37.14 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5227  beta-Ig-H3/fasciclin  29.01 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.273546  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  33.56 
 
 
187 aa  73.6  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  30.3 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  38.71 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  34.59 
 
 
201 aa  70.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  35 
 
 
222 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  29.55 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>