171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1108 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
166 aa  317  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  64.1 
 
 
187 aa  183  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  62.82 
 
 
166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  61.64 
 
 
161 aa  177  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  70.68 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  64.44 
 
 
165 aa  169  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  63.97 
 
 
163 aa  167  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  55.83 
 
 
187 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  55.21 
 
 
187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  55.21 
 
 
160 aa  161  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  65.47 
 
 
160 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  55.69 
 
 
194 aa  157  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  64.66 
 
 
134 aa  157  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  60.9 
 
 
156 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  60.9 
 
 
156 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  54.41 
 
 
186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  66.17 
 
 
141 aa  153  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  54.04 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  57.14 
 
 
195 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  53.46 
 
 
167 aa  149  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  55.15 
 
 
279 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  56.93 
 
 
162 aa  147  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  56.76 
 
 
191 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  62.41 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  53.73 
 
 
261 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  58.82 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  54.05 
 
 
193 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  52.69 
 
 
186 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  50.28 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  51.37 
 
 
178 aa  144  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  48.9 
 
 
184 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  53.9 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  52.26 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  54.05 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  52.6 
 
 
190 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  52.6 
 
 
190 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  50.97 
 
 
185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  53.9 
 
 
193 aa  137  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  54.01 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  49.64 
 
 
220 aa  137  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  52.9 
 
 
187 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 
184 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  48.3 
 
 
183 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  51.92 
 
 
183 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  52.26 
 
 
186 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  58.33 
 
 
133 aa  135  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  49.69 
 
 
184 aa  134  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  53.55 
 
 
191 aa  134  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  52.23 
 
 
184 aa  133  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  55.3 
 
 
133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  50.65 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  50.65 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  55.3 
 
 
133 aa  132  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  59.7 
 
 
157 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  47.4 
 
 
189 aa  130  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  54.14 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  54.1 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  58.2 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.52 
 
 
558 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  51.61 
 
 
184 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  49.68 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  47.18 
 
 
238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  53.03 
 
 
133 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  53.03 
 
 
133 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  49.03 
 
 
189 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  50.76 
 
 
151 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  47.44 
 
 
183 aa  121  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  54.79 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  44.6 
 
 
192 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  40.74 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  49.65 
 
 
169 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  45.14 
 
 
210 aa  112  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  44.85 
 
 
194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  46.77 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  44.87 
 
 
187 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  44.78 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  51.85 
 
 
315 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  42.95 
 
 
212 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.13 
 
 
308 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  44.93 
 
 
142 aa  104  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  42.47 
 
 
596 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  47.41 
 
 
611 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  41.35 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  45.04 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  47.2 
 
 
143 aa  99.8  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  41.79 
 
 
215 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  45.04 
 
 
163 aa  99  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  36.84 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  35.56 
 
 
135 aa  98.6  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  46.43 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.18 
 
 
133 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  37.04 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
222 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  33.58 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  35.9 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  46.27 
 
 
200 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  46.27 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>