165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1823 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
315 aa  615  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.49 
 
 
308 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  38.01 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  36.7 
 
 
330 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  34.97 
 
 
318 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  37.03 
 
 
611 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  51.85 
 
 
166 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  45.74 
 
 
160 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  46.88 
 
 
160 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  47.01 
 
 
167 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  47.14 
 
 
161 aa  99.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  46.92 
 
 
187 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  46.92 
 
 
166 aa  95.9  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 
134 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 
164 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  40.88 
 
 
279 aa  92.8  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.76 
 
 
141 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  45.19 
 
 
165 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 
160 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  46.56 
 
 
208 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  39.52 
 
 
163 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0404  hypothetical protein  41.26 
 
 
194 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000383864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.39 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  42.75 
 
 
187 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0450  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
184 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  38.92 
 
 
163 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  42.66 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  42.75 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  41.78 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  39.23 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  43.41 
 
 
184 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  40.41 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  35.29 
 
 
157 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  31.13 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  41.1 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 
140 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  30.79 
 
 
596 aa  80.5  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37290  predicted protein  40 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  37.67 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  44.96 
 
 
168 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  38.52 
 
 
133 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  40.59 
 
 
160 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  30.32 
 
 
510 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  39.04 
 
 
163 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  42.74 
 
 
161 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  41.94 
 
 
156 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  42.06 
 
 
194 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  38.17 
 
 
142 aa  77  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  41.94 
 
 
156 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  40.41 
 
 
186 aa  77  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  39.84 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  39.84 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  41.73 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  39.1 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  41.86 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  37.21 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.86 
 
 
558 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  44.35 
 
 
190 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  41.79 
 
 
183 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.62 
 
 
133 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 
186 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  36.96 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54395  fasciclin domain-containing protein  28.92 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  40.88 
 
 
157 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54396  fasciclin domain-containing protein  28.49 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  33.55 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  33.66 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.32 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  33.09 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  34.2 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  39.85 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  33.66 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  40.52 
 
 
183 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  39.84 
 
 
133 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  34.31 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  40.69 
 
 
184 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  43.81 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  34.65 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  36.71 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  34.48 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  34.01 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  37.97 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 
183 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  38.4 
 
 
143 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  39.73 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  34.9 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  37.97 
 
 
189 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  39.73 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  38.97 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  38.16 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  37.75 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  37.93 
 
 
193 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  38.36 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  37.09 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  40 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>