162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0405 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  98.5 
 
 		 200 aa  387  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  52.52 
 
 		 308 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  44.37 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  43.54 
 
 		 164 aa  98.6  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.96 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  40.56 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  43.04 
 
 		 346 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0596  beta-Ig-H3/fasciclin  32.32 
 
 		 216 aa  92  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  43.57 
 
 		 167 aa  91.7  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  40.51 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  46.27 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0450  beta-Ig-H3/fasciclin  35.48 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  43.11 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  37.76 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  40 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  35.76 
 
 		 194 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  42.57 
 
 		 330 aa  84.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  37.87 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  41.84 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  37.87 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  37.06 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  40.29 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0404  hypothetical protein  29.03 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000383864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  42.11 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  38.03 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  42.55 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  41.35 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  43.2 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  35.03 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  48.62 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  39.07 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  39.26 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  38.31 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  38.1 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  36.93 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  39.71 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  40.8 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  40.13 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  39.72 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  38.67 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  35.39 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  36.36 
 
 		 611 aa  78.2  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  38.69 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  39.22 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  40 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.01 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  40.14 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 		 596 aa  76.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  41.55 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  38.62 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.8 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  38.16 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  38.96 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  40.14 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  40.46 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  36 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  34.9 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  39.55 
 
 		 133 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  36.62 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  31.71 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.31 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  40.18 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  33.66 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  33.53 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.3 
 
 		 558 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  36.62 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  36.62 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  35.33 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  32.55 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  35.33 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  37.31 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  36.42 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  35.47 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  32.67 
 
 		 354 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  37.88 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.75 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  36.54 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  31.71 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  34.97 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  36.49 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  35.84 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  31.25 
 
 		 279 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  36.42 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  37.86 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  41.44 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  33.8 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  32.37 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  36.88 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  36 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  34.09 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  40.44 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>