168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2207 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 160 aa  317  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  77.5 
 
 		 160 aa  251  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  58.39 
 
 		 161 aa  185  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  48.78 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  48.78 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  58.2 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  51.15 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  50.38 
 
 		 187 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  45.21 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  48.09 
 
 		 134 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  45.21 
 
 		 187 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  43.79 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  45 
 
 		 161 aa  114  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  49.21 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  46.38 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  49.62 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  46.85 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  45.65 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 194 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  44.44 
 
 		 596 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  47.71 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  42.33 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  49.24 
 
 		 208 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  46.88 
 
 		 315 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  48.12 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  47.62 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 		 186 aa  103  9e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.88 
 
 		 261 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  43.7 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  49.12 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  36.48 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  48.87 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  43.85 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  43.85 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.44 
 
 		 220 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.08 
 
 		 133 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  48.57 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  40.97 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  43.08 
 
 		 133 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.55 
 
 		 558 aa  98.6  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  39.85 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  46.62 
 
 		 194 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  46.83 
 
 		 195 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  46.62 
 
 		 194 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  42.98 
 
 		 192 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  46.36 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 		 212 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  43.61 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  43.08 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  35.63 
 
 		 201 aa  95.5  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  40.41 
 
 		 202 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  44.22 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  41.67 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 222 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  42.47 
 
 		 184 aa  94  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 279 aa  94  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  46.62 
 
 		 202 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  44.36 
 
 		 186 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  43.06 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  39.26 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  44.36 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  45.14 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.27 
 
 		 139 aa  90.9  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  47.46 
 
 		 184 aa  90.9  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.59 
 
 		 308 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  42.22 
 
 		 184 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  46.62 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  41.22 
 
 		 217 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  36.09 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  44.36 
 
 		 193 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  39.39 
 
 		 225 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 141 aa  89  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  42.96 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 337 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  40.37 
 
 		 240 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  40.37 
 
 		 240 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  40.37 
 
 		 240 aa  87.8  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  41.01 
 
 		 611 aa  87.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  41.38 
 
 		 238 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  41.54 
 
 		 215 aa  87  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 224 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  44.36 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  38.61 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  42.4 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  41.04 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  43.61 
 
 		 190 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  39.88 
 
 		 227 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  38.85 
 
 		 193 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 229 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  43.61 
 
 		 190 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  35.77 
 
 		 134 aa  85.1  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  39.26 
 
 		 227 aa  84  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  38.57 
 
 		 301 aa  83.6  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.18 
 
 		 133 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  41.35 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>