166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0114 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 337 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  46.2 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  38.72 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.38 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  36.09 
 
 		 611 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  32.11 
 
 		 346 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  40.52 
 
 		 201 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 160 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  41.38 
 
 		 161 aa  92.8  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  43.75 
 
 		 166 aa  92.4  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  42.75 
 
 		 220 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.96 
 
 		 261 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54395  fasciclin domain-containing protein  29.17 
 
 		 437 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  42.96 
 
 		 167 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.75 
 
 		 194 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  39.6 
 
 		 164 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  38.93 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.76 
 
 		 558 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  40.71 
 
 		 160 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.57 
 
 		 141 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  42.18 
 
 		 162 aa  86.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  40.38 
 
 		 163 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  39.87 
 
 		 178 aa  85.9  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  43.97 
 
 		 208 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  42.86 
 
 		 166 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  41.83 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  37.75 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  37.75 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  41.96 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54396  fasciclin domain-containing protein  27 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  42.25 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  41.67 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  40.56 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  40.25 
 
 		 202 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  41.61 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  40.3 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  41.77 
 
 		 184 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  37.5 
 
 		 142 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  36.36 
 
 		 189 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  33.99 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 		 151 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.58 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  43.86 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  40.69 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  32.37 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  39.73 
 
 		 596 aa  76.3  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  38.06 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  40.54 
 
 		 195 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  41.94 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  38.82 
 
 		 184 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  40.97 
 
 		 133 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  41.94 
 
 		 190 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  32.64 
 
 		 134 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  43.85 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.94 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  32.37 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  35.81 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  43.85 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 		 186 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  39.31 
 
 		 191 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  35.81 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  33.58 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  39.74 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  40.13 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  41.33 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  38.78 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  38.93 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  36.99 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  35.62 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  33.49 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0021  beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  44 
 
 		 169 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 184 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  30.51 
 
 		 510 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  36.54 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  37.86 
 
 		 161 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  35.37 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  39.07 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  32.33 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  38.93 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  36.69 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  38.82 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  32.82 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5227  beta-Ig-H3/fasciclin  37.8 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.273546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  35.53 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  39.17 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  43.48 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  39.47 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  36.43 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  31.85 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  34.78 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  36.71 
 
 		 193 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>