122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54395 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_54395  fasciclin domain-containing protein  100 
 
 		 437 aa  865    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190413  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54396  fasciclin domain-containing protein  33.02 
 
 		 487 aa  136  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.44 
 
 		 308 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  29.84 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  32.35 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  32.74 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  34.45 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  36.81 
 
 		 163 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  32.43 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  28.53 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  33.1 
 
 		 208 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  33.95 
 
 		 150 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  29.63 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.68 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  30.46 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  30.22 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  30.92 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  30.46 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  31.55 
 
 		 191 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  28.74 
 
 		 315 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 261 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  31.61 
 
 		 183 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  33.12 
 
 		 162 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  30.12 
 
 		 192 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 		 165 aa  71.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.17 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  30.9 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  30.29 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  31.45 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  30.52 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  35.94 
 
 		 194 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  30.22 
 
 		 178 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  30.46 
 
 		 186 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  30.06 
 
 		 167 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  28.95 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  30.07 
 
 		 161 aa  68.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  28.9 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  30.92 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  29.8 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  29.8 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  31.47 
 
 		 156 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  27.5 
 
 		 187 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  34.78 
 
 		 143 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  31.47 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  27.63 
 
 		 183 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  30.82 
 
 		 184 aa  64.7  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  31.18 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  28.95 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  31.58 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  31.54 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  35.92 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  31.03 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  30.87 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.01 
 
 		 186 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 		 133 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  28.76 
 
 		 185 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  26.25 
 
 		 166 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 		 133 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  29.11 
 
 		 191 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  28.76 
 
 		 164 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  32.24 
 
 		 161 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  31.78 
 
 		 157 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  34.13 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  28.85 
 
 		 184 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  29.38 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  25.66 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  27.92 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  27.92 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  39.26 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  31.25 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  29.87 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.34 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  28.47 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  26.88 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  34.11 
 
 		 190 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  29.71 
 
 		 160 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  28.98 
 
 		 194 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  28.97 
 
 		 140 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  28.16 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  27.04 
 
 		 238 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  28.12 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  30.07 
 
 		 160 aa  57  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  27.67 
 
 		 160 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  33.79 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  25.85 
 
 		 183 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  28.99 
 
 		 157 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  28.24 
 
 		 215 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  28.5 
 
 		 222 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  30.71 
 
 		 179 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  30 
 
 		 184 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  28.95 
 
 		 163 aa  54.3  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  28.95 
 
 		 163 aa  54.3  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  31.29 
 
 		 200 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  34.35 
 
 		 168 aa  53.9  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  26.5 
 
 		 301 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.37 
 
 		 139 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.52 
 
 		 133 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  26.25 
 
 		 141 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  27.35 
 
 		 318 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 169 aa  53.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>