148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4432 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
318 aa  627  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0542  beta-Ig-H3/fasciclin  34.34 
 
 
330 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  39.33 
 
 
337 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  35.25 
 
 
315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.45 
 
 
308 aa  106  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  31.47 
 
 
611 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2197  beta-Ig-H3/fasciclin  30.58 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  39.85 
 
 
596 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  38.81 
 
 
178 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  32.35 
 
 
140 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  37.9 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  35.33 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  34.38 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  35.56 
 
 
166 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  36.3 
 
 
163 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4383  beta-Ig-H3/fasciclin  29.33 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.880113  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  31.14 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  31.14 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.74 
 
 
220 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.07 
 
 
261 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  37.76 
 
 
217 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 
134 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  34.75 
 
 
167 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  31.13 
 
 
157 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  32 
 
 
161 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.58 
 
 
186 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 
208 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 
215 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  34.97 
 
 
160 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.24 
 
 
141 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  33.07 
 
 
156 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  35.77 
 
 
164 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  33.87 
 
 
238 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  35.62 
 
 
157 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  35.07 
 
 
187 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  34.93 
 
 
142 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  34.81 
 
 
187 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  34.58 
 
 
156 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  33.64 
 
 
157 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  33.58 
 
 
161 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  32.52 
 
 
134 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54396  fasciclin domain-containing protein  26.72 
 
 
487 aa  59.3  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  35.11 
 
 
133 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  34.25 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5227  beta-Ig-H3/fasciclin  32.03 
 
 
138 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.273546  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  34.91 
 
 
192 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 
199 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.07 
 
 
558 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  34.25 
 
 
194 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  33.85 
 
 
194 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  32.88 
 
 
202 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  36.3 
 
 
185 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  35.19 
 
 
215 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  25.52 
 
 
510 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2219  beta-Ig-H3/fasciclin  23.36 
 
 
487 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  0.586919 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  36.09 
 
 
133 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  36.09 
 
 
133 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  38.83 
 
 
168 aa  55.8  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  36.61 
 
 
183 aa  55.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  36.79 
 
 
195 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  32.41 
 
 
231 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
279 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 
187 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0404  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000383864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  34.91 
 
 
193 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  33.11 
 
 
169 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  32.68 
 
 
184 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  38.02 
 
 
151 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  36.55 
 
 
200 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  36.55 
 
 
200 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
202 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 
216 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  29.51 
 
 
134 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  30.12 
 
 
201 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  31.97 
 
 
134 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54395  fasciclin domain-containing protein  27.35 
 
 
437 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  34.13 
 
 
166 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  27.08 
 
 
140 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  29.73 
 
 
185 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  30.91 
 
 
160 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
222 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.19 
 
 
139 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0278  beta-Ig-H3/fasciclin  32.86 
 
 
151 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216669  normal  0.0952762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  33.96 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  33.59 
 
 
133 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  31.86 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  34.69 
 
 
227 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0021  beta-Ig-H3/fasciclin  31.34 
 
 
141 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  31.86 
 
 
194 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  34.91 
 
 
191 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  33.96 
 
 
184 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  35.38 
 
 
143 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  32.14 
 
 
197 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  25 
 
 
141 aa  49.7  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  32.14 
 
 
197 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  32.14 
 
 
197 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  28.48 
 
 
184 aa  49.7  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  31.08 
 
 
184 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  31.19 
 
 
143 aa  49.3  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>