169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1271 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  313  8e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  59.49 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  58.39 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  57.93 
 
 		 163 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  57.93 
 
 		 163 aa  177  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  45.07 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  45.77 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  45.89 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.59 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  43.59 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  46.92 
 
 		 134 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  41.72 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.46 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  43.4 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  43.71 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  40.61 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  40.13 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  45.11 
 
 		 201 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 		 220 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  43.45 
 
 		 596 aa  105  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.44 
 
 		 261 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  41.92 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  42.94 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  44.59 
 
 		 202 aa  104  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  43.53 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  42.38 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  46.15 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  40.24 
 
 		 193 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  44.78 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 		 186 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  48.55 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  47.14 
 
 		 315 aa  100  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  41.61 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  45.45 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  45.45 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  40.24 
 
 		 194 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  39.74 
 
 		 215 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  42.22 
 
 		 190 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  44.1 
 
 		 202 aa  98.2  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  40.61 
 
 		 194 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  40.61 
 
 		 194 aa  97.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  46.21 
 
 		 168 aa  97.1  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  39.63 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  48.15 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  40.29 
 
 		 192 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 		 185 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  38.93 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.9 
 
 		 308 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  41.26 
 
 		 301 aa  95.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  46.97 
 
 		 208 aa  94.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  40.28 
 
 		 279 aa  94.7  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  43.57 
 
 		 142 aa  94  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  41.03 
 
 		 186 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  41.14 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  42.31 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  38.93 
 
 		 212 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 		 238 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  40.38 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  41.62 
 
 		 186 aa  92  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  40.38 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 		 240 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 		 240 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 		 240 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  38.67 
 
 		 222 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  39.62 
 
 		 193 aa  90.1  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.53 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  46.51 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  41.03 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  40.38 
 
 		 183 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  43.09 
 
 		 194 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  39.05 
 
 		 185 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  41.03 
 
 		 191 aa  88.2  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  38.16 
 
 		 217 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  33.91 
 
 		 272 aa  87.8  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 		 184 aa  87.8  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  36.22 
 
 		 134 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  38.22 
 
 		 189 aa  87.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  36.76 
 
 		 185 aa  87.4  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  33.09 
 
 		 143 aa  87.4  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  42.11 
 
 		 231 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  39.53 
 
 		 133 aa  87  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 227 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 225 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  35.11 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  33.87 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  35.16 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  39.18 
 
 		 184 aa  85.5  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  36.43 
 
 		 133 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  39.04 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  37.11 
 
 		 227 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  37.36 
 
 		 220 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  37.98 
 
 		 151 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  40.29 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  40.29 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  41.38 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>