170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0621 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  100 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  60.37 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  70.15 
 
 		 187 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  69.4 
 
 		 187 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  70.15 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  60.27 
 
 		 178 aa  167  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  53.01 
 
 		 187 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  59.86 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  61.48 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  59.26 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  61.74 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  54.55 
 
 		 161 aa  150  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  55.22 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  57.89 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  53.42 
 
 		 202 aa  147  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  56.93 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  57.14 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  53.64 
 
 		 186 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  51.4 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  55.26 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  52.59 
 
 		 558 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  53.68 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  59.85 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  48.35 
 
 		 184 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  58.09 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  55.1 
 
 		 193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  45.36 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  49.69 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  52.24 
 
 		 238 aa  137  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  49.66 
 
 		 279 aa  137  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  49.67 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  51.66 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  51.66 
 
 		 194 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  56.82 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  53.02 
 
 		 194 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  50.33 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  52.78 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  50.67 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  56.82 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  50.33 
 
 		 183 aa  134  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  56.39 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  53.1 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  50.99 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  56.16 
 
 		 194 aa  133  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  52.63 
 
 		 190 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  51.39 
 
 		 184 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  50.33 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  52.63 
 
 		 190 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  49.67 
 
 		 184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  57.45 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  52.29 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  50.32 
 
 		 189 aa  130  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  55.3 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  54.55 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  54.55 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  51.11 
 
 		 261 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  53.73 
 
 		 134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  56.3 
 
 		 190 aa  127  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  51.8 
 
 		 164 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  47.71 
 
 		 187 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  47.47 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  52 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  51.49 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  59.4 
 
 		 168 aa  120  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  50.74 
 
 		 194 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  45.96 
 
 		 183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  46.91 
 
 		 189 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  42.25 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  42.36 
 
 		 210 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  41.72 
 
 		 161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  42.33 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.27 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  41.89 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  50.71 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  41.79 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.01 
 
 		 139 aa  104  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  44.03 
 
 		 134 aa  104  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  47.97 
 
 		 596 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  43.28 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  53.17 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  47.83 
 
 		 611 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  48.94 
 
 		 184 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  40.13 
 
 		 202 aa  98.6  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  44.76 
 
 		 225 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  47.01 
 
 		 235 aa  97.4  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.76 
 
 		 308 aa  97.1  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  38.19 
 
 		 354 aa  95.9  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 		 229 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  42.45 
 
 		 201 aa  94.7  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  46.04 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  45.27 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  37.35 
 
 		 272 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  39.47 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  45.19 
 
 		 224 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  43.85 
 
 		 222 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  45.19 
 
 		 226 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>