168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4447 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  63.92 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  65.47 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  56.77 
 
 		 165 aa  170  6.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  65.93 
 
 		 187 aa  167  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  65.19 
 
 		 187 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  63.16 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  62.69 
 
 		 187 aa  160  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  63.43 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  60.87 
 
 		 156 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  61.59 
 
 		 156 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  62.41 
 
 		 208 aa  156  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  62.76 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  61.19 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  60.99 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  59.4 
 
 		 134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  60.45 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  55.47 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  57.45 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  56.52 
 
 		 279 aa  145  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  61.03 
 
 		 190 aa  144  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  62.41 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  48.12 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  51.32 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  49.66 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  50.71 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  48.05 
 
 		 184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  49.64 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  56.82 
 
 		 133 aa  134  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  50.68 
 
 		 202 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  51.47 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  48.68 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  51.37 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  53.03 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  53.79 
 
 		 133 aa  130  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  48.18 
 
 		 220 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  50 
 
 		 193 aa  129  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  44.26 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  53.79 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  51.08 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  45.7 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  53.79 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  46.84 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  53.79 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 261 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  54.84 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  48.68 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  48.92 
 
 		 194 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  54.47 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  47.37 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  47.97 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  47.26 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  47.26 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  59.7 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  49.32 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  49.32 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  51.88 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  46.67 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  43.86 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  46.05 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  47.26 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  47.71 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  45.95 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  44.3 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  46.62 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  47.79 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  44.53 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  40.29 
 
 		 192 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  41.61 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  41.49 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.04 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 202 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.38 
 
 		 558 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  42.14 
 
 		 210 aa  107  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  45.24 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  45.59 
 
 		 611 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  38.81 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  42.67 
 
 		 187 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  37.04 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  42.11 
 
 		 596 aa  99.8  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  35.56 
 
 		 134 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  35.34 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  42.25 
 
 		 169 aa  97.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 		 163 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  42.45 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.68 
 
 		 308 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  41.55 
 
 		 215 aa  95.5  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  44 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5227  beta-Ig-H3/fasciclin  41.54 
 
 		 138 aa  90.9  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.273546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  37.57 
 
 		 337 aa  90.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  31.34 
 
 		 135 aa  89.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  45.95 
 
 		 233 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  36.94 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  42.74 
 
 		 217 aa  88.2  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>