158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4534 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 217 aa  426  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  69.23 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  66.45 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  53.77 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  55.61 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  59.41 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  47.41 
 
 		 235 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  56.79 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  54.12 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  54.44 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  47.69 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  54.76 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  55.95 
 
 		 233 aa  157  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  47.58 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  44.8 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  44.8 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  53.09 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  44.8 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  47.39 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  52.5 
 
 		 193 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  45.6 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  51.95 
 
 		 194 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  51.55 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  51.55 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  51.55 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  47.5 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  52.44 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  52.1 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  43.84 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  36.18 
 
 		 199 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  38.31 
 
 		 187 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  37.81 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  41.61 
 
 		 596 aa  98.6  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  42.22 
 
 		 164 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  35.59 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  39.72 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2119  beta-Ig-H3/fasciclin  37.14 
 
 		 247 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  47.24 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  43.18 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  43.18 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  39.72 
 
 		 166 aa  93.2  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  45.67 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  46.46 
 
 		 133 aa  92.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  44.35 
 
 		 161 aa  92  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.72 
 
 		 261 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.26 
 
 		 141 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  38.75 
 
 		 169 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4077  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4153  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  44.26 
 
 		 165 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  41.22 
 
 		 160 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4307  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  45.04 
 
 		 162 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  45.45 
 
 		 133 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 178 aa  89  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.75 
 
 		 194 aa  88.6  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  42.75 
 
 		 133 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  40.82 
 
 		 166 aa  88.2  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  42.15 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  45.67 
 
 		 191 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  39.84 
 
 		 279 aa  87.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  38.16 
 
 		 161 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  39.39 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  38.93 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  40.83 
 
 		 134 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  43.18 
 
 		 160 aa  85.5  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  44.09 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  44.88 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.7 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.31 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  41.79 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  42.62 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  33.18 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  40.91 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  40.91 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  40.88 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  42.74 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  43.18 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  41.32 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  41.04 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.32 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  43.88 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  41.32 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  41.32 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  42.74 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  42.74 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  40.3 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  37.88 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 558 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  40.65 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  42.86 
 
 		 143 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  33.53 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  38.64 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  35.1 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  40.8 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  37.88 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>