154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0328 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  76.65 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  76.83 
 
 		 229 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  71.93 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  74.21 
 
 		 235 aa  238  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  60.85 
 
 		 227 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  71.88 
 
 		 197 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  71.88 
 
 		 197 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  71.88 
 
 		 197 aa  228  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  68.75 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  68.12 
 
 		 227 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  65.45 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  65.45 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  65.45 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  60.11 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  70.44 
 
 		 194 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  70.39 
 
 		 194 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  66.88 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  63.41 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  57.05 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  51.15 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  52.07 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  51.85 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  46.55 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  41.49 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  47.2 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  37.34 
 
 		 273 aa  121  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2119  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4077  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4153  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4307  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  43.36 
 
 		 166 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 199 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  38.18 
 
 		 611 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  40.56 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  43.42 
 
 		 166 aa  89  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 		 165 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  42.4 
 
 		 134 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  38.71 
 
 		 193 aa  85.9  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  42.52 
 
 		 187 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  41.73 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  37.68 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  42.52 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  45.95 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  38.52 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  38.16 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  42.73 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  39.72 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  39.58 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  43.52 
 
 		 168 aa  81.6  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  43.51 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  39.62 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  41.3 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.2 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  39.62 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  43.48 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.81 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  41.79 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  41.04 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  41.3 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  36.87 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  41.18 
 
 		 133 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.97 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  40.44 
 
 		 133 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  38.62 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  37.06 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  34.78 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  39.52 
 
 		 133 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  39.52 
 
 		 133 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.19 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 		 558 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  40.62 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  41.38 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  41.38 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  40.69 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  37.68 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  40.58 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  40.58 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  39.13 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  46.36 
 
 		 156 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  39.62 
 
 		 157 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  46.36 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  42.52 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  39.13 
 
 		 186 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  41.43 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  35.51 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  34.46 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  35.22 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  41.18 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  38.62 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  33.55 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  38.74 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  33.59 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  45.45 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>