132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4153 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4077  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4153  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4307  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  64.68 
 
 
273 aa  265  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2119  beta-Ig-H3/fasciclin  64.8 
 
 
247 aa  248  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  42.77 
 
 
240 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  42.77 
 
 
240 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  42.77 
 
 
240 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  44.78 
 
 
193 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  41.61 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  49.22 
 
 
194 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  45.57 
 
 
197 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  45.57 
 
 
197 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  45.57 
 
 
197 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  41.57 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  38.67 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  48.8 
 
 
214 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  40.24 
 
 
226 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  38.86 
 
 
235 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  42.54 
 
 
227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  47.06 
 
 
194 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  39.63 
 
 
224 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
233 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  38.73 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  39.58 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  37.78 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.78 
 
 
141 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  35.06 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  38.97 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  34.36 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  38.13 
 
 
164 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  36.69 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  31.79 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  35.56 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  36.3 
 
 
596 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  36.96 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  41.86 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  34.97 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  32.86 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  33.77 
 
 
165 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  42.86 
 
 
157 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  38.1 
 
 
143 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  44.55 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  42.72 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  42.15 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  45.1 
 
 
166 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  41.18 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 
187 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  35.66 
 
 
187 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  36.19 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  38.35 
 
 
133 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  33.78 
 
 
216 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  41 
 
 
133 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  35.38 
 
 
161 aa  62.4  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  43.27 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  45.63 
 
 
208 aa  62.4  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  41.96 
 
 
160 aa  62.4  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  35.37 
 
 
162 aa  62  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  31.78 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.37 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.6 
 
 
139 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  36.57 
 
 
133 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  38.21 
 
 
163 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.43 
 
 
261 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 
163 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  35.09 
 
 
142 aa  59.7  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 
151 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.35 
 
 
558 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  37.5 
 
 
161 aa  59.3  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 
163 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  37.19 
 
 
178 aa  58.9  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 
133 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 
133 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  36.21 
 
 
184 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  36.89 
 
 
160 aa  55.8  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  36.72 
 
 
190 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  36.72 
 
 
190 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  30.86 
 
 
354 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  39.29 
 
 
157 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  34.46 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  33.61 
 
 
183 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.51 
 
 
133 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  31.17 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  32.86 
 
 
201 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  36.04 
 
 
192 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.7 
 
 
308 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  27.06 
 
 
272 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  28.93 
 
 
141 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  29.36 
 
 
134 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 
184 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  34.35 
 
 
184 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  35.34 
 
 
611 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  33.58 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  34.21 
 
 
183 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  30.1 
 
 
134 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  32.32 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  31.97 
 
 
193 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>