156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1723 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1724  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 
143 aa  140  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  36.57 
 
 
187 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  36.57 
 
 
187 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  33.83 
 
 
134 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  38.06 
 
 
215 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  35.04 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  33.08 
 
 
161 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  33.58 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  37.68 
 
 
558 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 
238 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  30.6 
 
 
187 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  30.6 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.12 
 
 
261 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
279 aa  91.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 
220 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  31.82 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
160 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  34.65 
 
 
163 aa  88.2  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  35.48 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  32.09 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  30.08 
 
 
166 aa  87  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 
140 aa  87.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.08 
 
 
186 aa  86.7  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  30.94 
 
 
192 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.86 
 
 
133 aa  84.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  37.38 
 
 
190 aa  85.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  33.86 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 
208 aa  84.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  33.94 
 
 
194 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  30.3 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  26.87 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0021  beta-Ig-H3/fasciclin  30.53 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  29.63 
 
 
160 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  30.53 
 
 
596 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  32.52 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  32.28 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  32.28 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  29.85 
 
 
160 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  29.37 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  32.28 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  30.82 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  27.82 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  30.88 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  30.82 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  29.63 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  29.86 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  30.67 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  29.33 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  29.1 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  29.1 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  32.17 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  28.36 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  30.07 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  27.82 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 
168 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  33.78 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  27.82 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  29.05 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  28.36 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  26.47 
 
 
272 aa  71.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  27.74 
 
 
194 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  33.96 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  28.77 
 
 
185 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1726  beta-Ig-H3/fasciclin  30.88 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  29.45 
 
 
184 aa  70.5  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  27.4 
 
 
186 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  28.08 
 
 
187 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  31.86 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  28.08 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  28.78 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  28.77 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  30.88 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  27.82 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  30.2 
 
 
184 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.12 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  26.85 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  27.21 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  27.33 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  30.77 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  29.85 
 
 
611 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  28.67 
 
 
308 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  38.67 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  27.4 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  30.77 
 
 
200 aa  63.9  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  30.83 
 
 
212 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  31.07 
 
 
214 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  25.68 
 
 
193 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2200  beta-Ig-H3/fasciclin  27.82 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.474723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  32.54 
 
 
222 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  29.45 
 
 
186 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 
200 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  31.76 
 
 
187 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>