144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2081 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  40.67 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  43.31 
 
 
215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  42.76 
 
 
212 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  43.57 
 
 
222 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  35.61 
 
 
217 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  36.42 
 
 
222 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  38.31 
 
 
231 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  40.28 
 
 
226 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  36.32 
 
 
216 aa  99  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  40.12 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  39.57 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  36.42 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
233 aa  94.7  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  38.65 
 
 
229 aa  94  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  38.46 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  37.57 
 
 
224 aa  92  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  39.16 
 
 
235 aa  91.3  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  40.32 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  37.42 
 
 
240 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  37.42 
 
 
240 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  37.42 
 
 
240 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  36.31 
 
 
227 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  40.43 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  40.43 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  40.43 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  40.32 
 
 
194 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  31.58 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  32.37 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2119  beta-Ig-H3/fasciclin  31.87 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  30.88 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  27.68 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4077  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4153  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4307  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615408  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  30.89 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  34.43 
 
 
279 aa  68.2  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  31.25 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  30.89 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  30.12 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.84 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.4 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  29.52 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.75 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  27.61 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  30.89 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.61 
 
 
141 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  32.23 
 
 
596 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  30.72 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  30.72 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  30.95 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  28.33 
 
 
139 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  31.4 
 
 
134 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  33.6 
 
 
611 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  33.08 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2962  secreted and surface protein  25.95 
 
 
140 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154745  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  32.58 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  32.26 
 
 
156 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  30.65 
 
 
162 aa  58.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  30 
 
 
238 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  32.26 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 
134 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  31.63 
 
 
168 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  31.62 
 
 
184 aa  58.2  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  27.27 
 
 
139 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  32.65 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  32.52 
 
 
133 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  29.41 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  36.09 
 
 
134 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 
133 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  31.11 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  28 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  28.37 
 
 
157 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 
133 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  29.84 
 
 
165 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 
151 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4432  beta-Ig-H3/fasciclin  38.1 
 
 
318 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370103  normal  0.663169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  28.57 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 
133 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  26.21 
 
 
160 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  32.52 
 
 
208 aa  55.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  35 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  28.68 
 
 
160 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  28.33 
 
 
133 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  29.13 
 
 
161 aa  55.5  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  28.69 
 
 
160 aa  55.1  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  30.61 
 
 
201 aa  55.1  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  27.21 
 
 
143 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  32.54 
 
 
194 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  32 
 
 
157 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  30.65 
 
 
134 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  29.85 
 
 
184 aa  54.7  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  29.63 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  26.44 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  28.57 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  33.33 
 
 
143 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>