143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4788 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 222 aa  430  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  68.71 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  62.42 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  59.88 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  49.77 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  53.07 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  46.4 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  54.66 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  48.17 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  41.91 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  50 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  47.65 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  43.07 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  46.47 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  47.06 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  45.88 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  45.14 
 
 		 233 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  46.39 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  44.71 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  44.71 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  44.71 
 
 		 240 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  43.9 
 
 		 193 aa  121  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 		 197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 		 197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 		 197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  47.37 
 
 		 194 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  47.93 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  46.86 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  35.9 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  35.09 
 
 		 273 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2119  beta-Ig-H3/fasciclin  33.87 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  34.43 
 
 		 133 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  34.81 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  34.43 
 
 		 133 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  34.33 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  35.46 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  33.82 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  34.48 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4077  beta-Ig-H3/fasciclin  31.79 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4153  beta-Ig-H3/fasciclin  31.79 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4307  beta-Ig-H3/fasciclin  31.79 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  35.46 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  34.33 
 
 		 596 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  35.9 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  35.29 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  33.86 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  30.15 
 
 		 134 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.87 
 
 		 133 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  36.3 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  33.07 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  34.07 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  30.56 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  32.81 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  34.56 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  32.81 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  32.59 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  34.81 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  33.86 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.77 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  34.07 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  31.06 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  34.11 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  31.21 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  32.84 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.65 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  29.17 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  30.65 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  32.59 
 
 		 161 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  31.91 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  37.86 
 
 		 611 aa  62  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  29.63 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  30.65 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  34.38 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.88 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  31.91 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  30.07 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  32.62 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  32.39 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  30.5 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  33.57 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  31.69 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  31.21 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  32.69 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  30.5 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  30.5 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  31.5 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  30.47 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  32.84 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  32.39 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  32.33 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  30.83 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  31.37 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.19 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0596  beta-Ig-H3/fasciclin  32.14 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  26.92 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  29.55 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  30.48 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  23.92 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>