166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1655 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
596 aa  1152    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  54.89 
 
 
167 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  51.43 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  49.59 
 
 
161 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  45.35 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  39.88 
 
 
187 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.43 
 
 
220 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  41.67 
 
 
166 aa  115  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  50.4 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  49.6 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  30.42 
 
 
611 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  43.7 
 
 
165 aa  112  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  47.1 
 
 
163 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  43.86 
 
 
161 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  40.34 
 
 
178 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  44.44 
 
 
160 aa  108  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.38 
 
 
261 aa  107  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  44.6 
 
 
195 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 
141 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  44.44 
 
 
186 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  40.82 
 
 
193 aa  106  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  48.03 
 
 
162 aa  106  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  50.82 
 
 
156 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  43.51 
 
 
134 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
166 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  50.82 
 
 
156 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  44.7 
 
 
160 aa  104  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
201 aa  104  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  41.55 
 
 
279 aa  104  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  45.8 
 
 
225 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  44 
 
 
139 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  45.11 
 
 
238 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  41.98 
 
 
217 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  41.18 
 
 
194 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  44.62 
 
 
133 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  42.21 
 
 
193 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  45.38 
 
 
133 aa  99.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  43.84 
 
 
186 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  39.67 
 
 
134 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.39 
 
 
308 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.45 
 
 
558 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  44.7 
 
 
208 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  50.39 
 
 
157 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  40.22 
 
 
193 aa  98.2  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  43.84 
 
 
191 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  40.52 
 
 
191 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  41.01 
 
 
184 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  45.38 
 
 
133 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  45.38 
 
 
133 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.85 
 
 
133 aa  97.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  45.16 
 
 
212 aa  97.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  38.84 
 
 
134 aa  97.1  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  44.08 
 
 
169 aa  96.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  38.33 
 
 
134 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  42.97 
 
 
163 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  51.46 
 
 
168 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  42.97 
 
 
163 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  42.42 
 
 
231 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  41.09 
 
 
220 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  42.86 
 
 
142 aa  94.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  48 
 
 
194 aa  94  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  41.5 
 
 
194 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  42.47 
 
 
190 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  40.82 
 
 
185 aa  93.2  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  42.47 
 
 
190 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  40.46 
 
 
194 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  39.53 
 
 
227 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  43.48 
 
 
184 aa  92  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  42.96 
 
 
160 aa  92  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  41.78 
 
 
202 aa  92  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  44 
 
 
215 aa  91.3  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  39.89 
 
 
184 aa  90.9  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  39.53 
 
 
227 aa  90.9  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  40.82 
 
 
183 aa  90.5  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  38.46 
 
 
235 aa  90.5  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  40.31 
 
 
240 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  39.51 
 
 
183 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  40.31 
 
 
240 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  35.61 
 
 
142 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  40.31 
 
 
240 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2972  secreted and surface protein  41.27 
 
 
143 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.143702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  40.54 
 
 
184 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
186 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  33.5 
 
 
272 aa  88.6  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  36.81 
 
 
301 aa  88.6  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
187 aa  88.6  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  41.41 
 
 
214 aa  88.2  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  38.76 
 
 
233 aa  88.2  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  35.61 
 
 
140 aa  88.2  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  36.27 
 
 
194 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  36.27 
 
 
194 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  42.38 
 
 
150 aa  87.8  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  47.22 
 
 
157 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 
184 aa  87.8  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  42.62 
 
 
222 aa  87.4  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  35.42 
 
 
184 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  39.13 
 
 
197 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  37.84 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  39.13 
 
 
197 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  39.13 
 
 
197 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.113432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>