168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3373 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  62.5 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  63.38 
 
 
187 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  62.68 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  61.81 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  55.69 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  61.81 
 
 
187 aa  167  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  58.27 
 
 
279 aa  165  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  60.43 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  58.45 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  61.48 
 
 
160 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  53.52 
 
 
261 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  61.94 
 
 
161 aa  156  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  60.99 
 
 
160 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  55.15 
 
 
220 aa  154  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  59.85 
 
 
156 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  59.85 
 
 
156 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  55.24 
 
 
178 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  60.9 
 
 
134 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  57.02 
 
 
186 aa  148  6e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  56.16 
 
 
162 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  60.9 
 
 
141 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  58.09 
 
 
208 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  59.56 
 
 
157 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  49.19 
 
 
195 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  46.38 
 
 
558 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  53.74 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  58.74 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  55.71 
 
 
193 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  50.57 
 
 
191 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  43.59 
 
 
194 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  43.59 
 
 
194 aa  135  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  55.71 
 
 
194 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  57.66 
 
 
168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  51.59 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  51.3 
 
 
185 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  48.47 
 
 
193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  50.34 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  51.02 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  56.06 
 
 
133 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  46.11 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  49.66 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  48.7 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  53.79 
 
 
133 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  56.1 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  51.7 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  45.89 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  48.39 
 
 
189 aa  125  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  45.22 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  54.55 
 
 
133 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  49.66 
 
 
184 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  43.33 
 
 
191 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  41.4 
 
 
238 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  49.66 
 
 
186 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  49.66 
 
 
184 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  51.52 
 
 
151 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  47.44 
 
 
184 aa  121  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  50.34 
 
 
184 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  50.34 
 
 
190 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  52.27 
 
 
133 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  52.27 
 
 
133 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  50.34 
 
 
190 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  41.67 
 
 
194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  45.81 
 
 
184 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  44.81 
 
 
184 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  41.55 
 
 
192 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  45.77 
 
 
164 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  46.94 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  44.85 
 
 
187 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  44.3 
 
 
183 aa  111  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.37 
 
 
139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  45.24 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  41.78 
 
 
212 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  40.97 
 
 
160 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 
160 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.51 
 
 
133 aa  104  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  39.58 
 
 
210 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  41.04 
 
 
140 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  41.33 
 
 
217 aa  101  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  47.15 
 
 
596 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  38.1 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  44.12 
 
 
611 aa  99.4  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  43.9 
 
 
163 aa  99  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  48 
 
 
143 aa  99  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  43.9 
 
 
163 aa  98.2  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  38.16 
 
 
222 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  43.94 
 
 
142 aa  97.1  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  40.6 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  43.48 
 
 
169 aa  94.4  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  38.26 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0114  beta-Ig-H3/fasciclin  42.66 
 
 
337 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.868659  normal  0.166356 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  42.34 
 
 
308 aa  91.7  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  30.88 
 
 
141 aa  91.7  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  36.48 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  32.09 
 
 
142 aa  90.5  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  35.82 
 
 
134 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  30.85 
 
 
272 aa  88.6  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  45.54 
 
 
240 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>