156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12890 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  100 
 
 
193 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  72.51 
 
 
220 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  68.75 
 
 
233 aa  227  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  72.5 
 
 
214 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  66.67 
 
 
224 aa  222  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  69.14 
 
 
227 aa  222  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  66.05 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  67.07 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  67.07 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  67.07 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  65.43 
 
 
226 aa  217  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  68.94 
 
 
197 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  68.94 
 
 
197 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  68.94 
 
 
197 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  66.05 
 
 
235 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  65.85 
 
 
227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  60.94 
 
 
194 aa  208  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  64.6 
 
 
227 aa  207  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  58.85 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  53.74 
 
 
225 aa  148  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  52.5 
 
 
217 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  50.3 
 
 
215 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  49.7 
 
 
212 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  47.9 
 
 
231 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  47.06 
 
 
222 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  41.07 
 
 
273 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2119  beta-Ig-H3/fasciclin  42.77 
 
 
247 aa  131  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  43.53 
 
 
222 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  44.24 
 
 
216 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4077  beta-Ig-H3/fasciclin  44.85 
 
 
247 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4153  beta-Ig-H3/fasciclin  44.85 
 
 
247 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4307  beta-Ig-H3/fasciclin  44.85 
 
 
247 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615408  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  36.93 
 
 
596 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 
167 aa  97.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  39.46 
 
 
166 aa  94.4  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 
218 aa  94.4  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  40.4 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  40.46 
 
 
134 aa  92.8  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  40.85 
 
 
160 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  40.14 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  43.24 
 
 
161 aa  89.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  36.5 
 
 
195 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  38.97 
 
 
164 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  42.07 
 
 
186 aa  87.8  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  38.26 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 
187 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  41.22 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  38.85 
 
 
160 aa  85.1  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  41.79 
 
 
169 aa  84.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  39.58 
 
 
160 aa  84.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  43.52 
 
 
141 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  37.87 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  41.3 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  39.71 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  39.86 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  39.86 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  36.94 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  37.93 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  38.6 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  38.6 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  38.52 
 
 
161 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  39.31 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  37.09 
 
 
611 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  39.55 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  39.25 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  36.92 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  36.9 
 
 
202 aa  79  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.81 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  32.06 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  37.93 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  32.66 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  37.93 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  38.24 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  40.74 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  40.74 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
558 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.65 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  37.93 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  37.93 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  39.81 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  37.24 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  38.62 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  41.44 
 
 
157 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  33.79 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  38.62 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  37.24 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.25 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  33.85 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  39.46 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  40.91 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  37.27 
 
 
163 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  33.04 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.45 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  39.22 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>