161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1085 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  100 
 
 		 134 aa  270  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  79.85 
 
 		 134 aa  225  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  79.85 
 
 		 134 aa  221  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  41.79 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  39.1 
 
 		 166 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  37.59 
 
 		 187 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  41.35 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.85 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  38.81 
 
 		 187 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  37.59 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  38.06 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  37.12 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  39.55 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  42.86 
 
 		 167 aa  94.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  37.82 
 
 		 596 aa  94  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  36.84 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  38.89 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  37.24 
 
 		 186 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  35.61 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  35.61 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  36.55 
 
 		 202 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.07 
 
 		 186 aa  90.9  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4858  beta-Ig-H3/fasciclin  35.11 
 
 		 151 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  36.57 
 
 		 178 aa  90.5  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  34.59 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  38.06 
 
 		 157 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  33.58 
 
 		 238 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  36.22 
 
 		 161 aa  87.4  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  35.25 
 
 		 201 aa  87  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  37.24 
 
 		 187 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  35.42 
 
 		 190 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  35.42 
 
 		 190 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  36.49 
 
 		 184 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  35.77 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  33.83 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 		 208 aa  85.5  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.81 
 
 		 558 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  35.07 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  35.81 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  35.42 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  34.69 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.12 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  35.37 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  32.41 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  36.36 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  34.48 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  35.34 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  33.56 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  34.48 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  34.13 
 
 		 195 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  31.88 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  35.17 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  35.17 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  30.43 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  35.24 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  31.97 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  34.65 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  31.39 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  34.25 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  34.13 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3001  hypothetical protein  40.35 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100606  hitchhiker  0.00156356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  33.83 
 
 		 611 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  33.6 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  31.58 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  31.97 
 
 		 183 aa  73.6  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  34.31 
 
 		 194 aa  73.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  33.85 
 
 		 193 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  34.65 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  33.83 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1723  beta-Ig-H3/fasciclin  27.82 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  33.1 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  33.6 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  32.84 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  31.34 
 
 		 183 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  35.38 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  31.39 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  30.43 
 
 		 192 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  35.88 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  32.41 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  35.51 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0949  beta-Ig-H3/fasciclin  32.06 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  35.04 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  35.04 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  35.04 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2094  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.55 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.679914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  30.34 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  31.72 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  32.31 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  33.08 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  30.83 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  33.59 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>